More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2368 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 441 aa  876    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  49.55 
 
 		 494 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.68 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  51.36 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 		 442 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.01 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  51.02 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  50.9 
 
 		 465 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.57 
 
 		 439 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.17 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 		 442 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  50.57 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  49.32 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 		 440 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.79 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  48.41 
 
 		 443 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.72 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.42 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.77 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  47.76 
 
 		 440 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  50.34 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  50.23 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  49.43 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.3 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.19 
 
 		 488 aa  363  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  49.21 
 
 		 477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.07 
 
 		 495 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  48.07 
 
 		 452 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.06 
 
 		 462 aa  358  9e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  46.34 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.34 
 
 		 475 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  47.65 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.56 
 
 		 475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  46.5 
 
 		 439 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  49.66 
 
 		 435 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.51 
 
 		 444 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.1 
 
 		 454 aa  345  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.06 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.52 
 
 		 451 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  38.36 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  44.74 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  39.64 
 
 		 440 aa  293  3e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  38.06 
 
 		 440 aa  294  3e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.91 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  37.9 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  38.64 
 
 		 443 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.32 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.44 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.36 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.36 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 		 442 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  36.79 
 
 		 438 aa  282  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.36 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  36.79 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  38.44 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.36 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.48 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  40.54 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  36.82 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  37.03 
 
 		 445 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.81 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.05 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.91 
 
 		 435 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 		 436 aa  276  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.76 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.31 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.42 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.06 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  37.99 
 
 		 454 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.22 
 
 		 440 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  39.25 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.09 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.67 
 
 		 438 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.55 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 		 436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.93 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.36 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  37.99 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  36.36 
 
 		 445 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.37 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.58 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  37.99 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>