More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0034 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  893    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  61.19 
 
 
438 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 
439 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.18 
 
 
456 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.64 
 
 
437 aa  518  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  59.55 
 
 
439 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.11 
 
 
439 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  59.01 
 
 
437 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.32 
 
 
435 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  55.08 
 
 
443 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.08 
 
 
442 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.3 
 
 
440 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.5 
 
 
442 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.3 
 
 
440 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.5 
 
 
442 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  55.3 
 
 
494 aa  472  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  54.4 
 
 
465 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.28 
 
 
454 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.4 
 
 
439 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.08 
 
 
446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.08 
 
 
444 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  56.21 
 
 
494 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  54.4 
 
 
443 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  55.3 
 
 
437 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.82 
 
 
488 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.75 
 
 
444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  54.9 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  53.59 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.96 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.08 
 
 
440 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  52.7 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  53.27 
 
 
477 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.3 
 
 
490 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.55 
 
 
475 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.22 
 
 
475 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  54.05 
 
 
443 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.75 
 
 
465 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.6 
 
 
462 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.94 
 
 
547 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  48.25 
 
 
474 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  53.32 
 
 
434 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.62 
 
 
438 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.76 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.76 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.79 
 
 
438 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.77 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
438 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.31 
 
 
434 aa  327  3e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.97 
 
 
462 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.9 
 
 
436 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
434 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.95 
 
 
434 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.08 
 
 
440 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
446 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.82 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
438 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.99 
 
 
435 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.48 
 
 
439 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.22 
 
 
438 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 
463 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
434 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
435 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 
438 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
438 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
439 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
438 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  40.43 
 
 
457 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.05 
 
 
452 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
433 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
463 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
441 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.89 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  39.28 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 
475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  39.28 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.28 
 
 
436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  40.44 
 
 
447 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 
441 aa  313  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.07 
 
 
443 aa  312  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.5 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.33 
 
 
443 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.28 
 
 
438 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.58 
 
 
459 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.06 
 
 
427 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.63 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.39 
 
 
467 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
440 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
440 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.35 
 
 
438 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.43 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.29 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.61 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.61 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  39.74 
 
 
467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>