More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0931 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  85.97 
 
 
442 aa  773    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
442 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
442 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.86 
 
 
444 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  68.72 
 
 
446 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  67.43 
 
 
443 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  68.66 
 
 
434 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.12 
 
 
439 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  64.03 
 
 
437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.8 
 
 
439 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  62.73 
 
 
465 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  62.39 
 
 
439 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.22 
 
 
456 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  60.96 
 
 
438 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
443 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  59.59 
 
 
494 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  59 
 
 
439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.19 
 
 
440 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.55 
 
 
462 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  60.5 
 
 
452 aa  507  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  60.73 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  58.41 
 
 
437 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.39 
 
 
440 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.5 
 
 
437 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.39 
 
 
440 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 
439 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.87 
 
 
490 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
477 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.53 
 
 
547 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.5 
 
 
495 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.64 
 
 
444 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.28 
 
 
488 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.46 
 
 
475 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  56.5 
 
 
440 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
475 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  52.46 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.42 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 
435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.89 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.56 
 
 
454 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50 
 
 
438 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.55 
 
 
441 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  44.42 
 
 
438 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.57 
 
 
438 aa  359  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 
443 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.99 
 
 
451 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  50.13 
 
 
434 aa  352  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.69 
 
 
442 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.89 
 
 
447 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  42.6 
 
 
435 aa  346  6e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.82 
 
 
437 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  42.56 
 
 
442 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.69 
 
 
434 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  42.33 
 
 
441 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.61 
 
 
440 aa  342  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  42.47 
 
 
456 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
438 aa  341  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 
438 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.14 
 
 
434 aa  340  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.14 
 
 
443 aa  339  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  43.15 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.95 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.5 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.14 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.5 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 
434 aa  335  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.23 
 
 
439 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  41.32 
 
 
434 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  40.63 
 
 
449 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.5 
 
 
434 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.36 
 
 
478 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
438 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  42.6 
 
 
466 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.72 
 
 
436 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.69 
 
 
434 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.55 
 
 
436 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  41.32 
 
 
436 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.88 
 
 
439 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  44.22 
 
 
434 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  41.1 
 
 
434 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 
434 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 
452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.18 
 
 
435 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 
438 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
437 aa  328  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
437 aa  328  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.21 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.08 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.05 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.41 
 
 
436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.55 
 
 
434 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.55 
 
 
434 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
443 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.05 
 
 
478 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.67 
 
 
440 aa  325  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.41 
 
 
436 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  37.95 
 
 
435 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  44.52 
 
 
431 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.41 
 
 
435 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>