More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_02040 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 494 aa  968    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.82 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  57.75 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.24 
 
 		 437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.68 
 
 		 439 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.35 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  58.37 
 
 		 439 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  57.3 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  57.49 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  55.68 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.01 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.1 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.81 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  54.61 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.16 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.44 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  53.81 
 
 		 443 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.97 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.18 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.15 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.15 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.88 
 
 		 444 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.89 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.89 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  53.81 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.89 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.38 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.31 
 
 		 547 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  51.55 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.16 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.87 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  53.79 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.38 
 
 		 490 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.38 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  51.92 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  48.8 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  50.45 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  50.78 
 
 		 452 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  54.79 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.76 
 
 		 438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.87 
 
 		 441 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  42.48 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.8 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.86 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  42.6 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  42.6 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.02 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.35 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 		 466 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.26 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.47 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 		 434 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.81 
 
 		 459 aa  309  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 		 457 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.72 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.12 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  39.43 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 443 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  39.1 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  37.89 
 
 		 453 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 		 434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  39.1 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.45 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 		 438 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  43.36 
 
 		 446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 		 438 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.06 
 
 		 436 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.87 
 
 		 446 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 		 439 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.6 
 
 		 438 aa  302  9e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 		 438 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.49 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.15 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.14 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.83 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.83 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.44 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 		 437 aa  300  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.28 
 
 		 442 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.76 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.83 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.6 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  40.71 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  39.78 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  38.57 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  36.63 
 
 		 463 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.58 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  38.93 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.44 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>