More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3879 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
443 aa  885    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  77.6 
 
 
462 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.21 
 
 
439 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  65.52 
 
 
443 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  66.21 
 
 
437 aa  568  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.29 
 
 
439 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.73 
 
 
442 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.73 
 
 
442 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  62.9 
 
 
439 aa  531  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.22 
 
 
442 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.05 
 
 
456 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.27 
 
 
444 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.29 
 
 
490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.46 
 
 
547 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  60.18 
 
 
443 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.82 
 
 
446 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  59.68 
 
 
465 aa  507  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  57.7 
 
 
494 aa  505  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.01 
 
 
444 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  56.98 
 
 
437 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.1 
 
 
440 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  57.4 
 
 
438 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.42 
 
 
475 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  58.58 
 
 
477 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  57.74 
 
 
434 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.03 
 
 
495 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.53 
 
 
475 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  56.46 
 
 
439 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.9 
 
 
440 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.9 
 
 
440 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  56.65 
 
 
452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.18 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 
439 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  54.05 
 
 
440 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.11 
 
 
437 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  58.9 
 
 
435 aa  458  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  51.56 
 
 
474 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.15 
 
 
488 aa  451  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  53.79 
 
 
494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.12 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.95 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.43 
 
 
441 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  50.39 
 
 
434 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 
427 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.84 
 
 
438 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.74 
 
 
438 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  41.44 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.44 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.51 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  41.22 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.44 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.44 
 
 
435 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.23 
 
 
434 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.18 
 
 
440 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.5 
 
 
438 aa  333  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 
444 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.65 
 
 
436 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.42 
 
 
439 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.1 
 
 
438 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 
434 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  44.22 
 
 
434 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  41.35 
 
 
440 aa  329  8e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.46 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  38.6 
 
 
445 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 
449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  38.24 
 
 
445 aa  326  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.63 
 
 
446 aa  326  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
436 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.04 
 
 
443 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  40.37 
 
 
436 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
442 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  39.55 
 
 
440 aa  323  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  39.77 
 
 
448 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  39.19 
 
 
438 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.91 
 
 
434 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
434 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.78 
 
 
445 aa  323  4e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  38.13 
 
 
435 aa  323  4e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.03 
 
 
447 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
434 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.23 
 
 
438 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
447 aa  322  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
440 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
440 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 
463 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  42.46 
 
 
475 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.77 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.13 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.67 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.96 
 
 
446 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.13 
 
 
437 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.16 
 
 
453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  37.98 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>