More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2817 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
446 aa  916    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.5 
 
 
440 aa  675    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  70.68 
 
 
440 aa  660    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.05 
 
 
447 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.59 
 
 
446 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  65.68 
 
 
443 aa  605  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.14 
 
 
452 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  63.57 
 
 
446 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  64.03 
 
 
448 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.03 
 
 
448 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.03 
 
 
448 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.69 
 
 
448 aa  591  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  64.48 
 
 
448 aa  593  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.27 
 
 
442 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  62.5 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.92 
 
 
463 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 
446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  62.95 
 
 
464 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  62.5 
 
 
464 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  62.72 
 
 
447 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  62.22 
 
 
450 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.96 
 
 
445 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.91 
 
 
459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.95 
 
 
458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.59 
 
 
446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.23 
 
 
447 aa  559  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
447 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.59 
 
 
464 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  60.45 
 
 
440 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.41 
 
 
444 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  59.77 
 
 
445 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.59 
 
 
464 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
450 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.23 
 
 
449 aa  552  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 
445 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  60.22 
 
 
450 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  58.56 
 
 
449 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  58.73 
 
 
445 aa  547  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  58.81 
 
 
454 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  58.82 
 
 
445 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.59 
 
 
457 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  58.37 
 
 
454 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  56.82 
 
 
445 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.09 
 
 
442 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.64 
 
 
440 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.68 
 
 
440 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  58.64 
 
 
442 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.41 
 
 
439 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  58.41 
 
 
445 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  55.91 
 
 
440 aa  520  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.4 
 
 
449 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.72 
 
 
450 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.28 
 
 
450 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.64 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.64 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  56.64 
 
 
470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.5 
 
 
442 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.29 
 
 
457 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.26 
 
 
466 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.19 
 
 
470 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  56.73 
 
 
450 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  56.04 
 
 
467 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  57.05 
 
 
440 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  55.75 
 
 
453 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.58 
 
 
457 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.26 
 
 
466 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  56.26 
 
 
466 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  55.38 
 
 
470 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.97 
 
 
470 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.26 
 
 
466 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.42 
 
 
473 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  55.75 
 
 
470 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  55.23 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  56.04 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  56.42 
 
 
473 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  56.17 
 
 
454 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  56.04 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.86 
 
 
473 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  59.95 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.38 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.22 
 
 
457 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  56.19 
 
 
470 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.82 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  55.28 
 
 
451 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.54 
 
 
473 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  55.51 
 
 
450 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  54.75 
 
 
482 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.79 
 
 
442 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  55.35 
 
 
440 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 
466 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.13 
 
 
453 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.24 
 
 
454 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.13 
 
 
445 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.48 
 
 
445 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.3 
 
 
482 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  54.98 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  53.52 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.81 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 
466 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 
466 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>