More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2024 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  930    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  62.64 
 
 		 446 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.73 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.36 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  61.73 
 
 		 446 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  62.13 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.41 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.36 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  58.73 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  58.73 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  58.73 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  60.14 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  60.14 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  59.64 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.45 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  59.23 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  58.69 
 
 		 449 aa  528  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 		 449 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.11 
 
 		 458 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 		 452 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  58.05 
 
 		 447 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  58.54 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.53 
 
 		 442 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  58.86 
 
 		 439 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  57.53 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  57.43 
 
 		 450 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  57.53 
 
 		 442 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.18 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.81 
 
 		 459 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.21 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  55.65 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  55.43 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.76 
 
 		 466 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  56.95 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  55.22 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  53.68 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.22 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.22 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  56.04 
 
 		 445 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.86 
 
 		 440 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.88 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55 
 
 		 466 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  53.45 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.88 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.72 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.51 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  56.26 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.98 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.14 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  54.65 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  55.12 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.65 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.76 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  53.29 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.9 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.33 
 
 		 466 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.76 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.33 
 
 		 466 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  54.44 
 
 		 445 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  54.1 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  53.74 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.32 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.33 
 
 		 466 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.33 
 
 		 466 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.74 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.55 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.44 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  53.99 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  53.64 
 
 		 453 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.26 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  53.67 
 
 		 454 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  53.45 
 
 		 454 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.52 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  53.86 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  52.7 
 
 		 450 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.53 
 
 		 442 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  57.14 
 
 		 407 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.69 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.98 
 
 		 482 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.02 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  51.25 
 
 		 440 aa  458  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>