More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.29 
 
 		 464 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.06 
 
 		 464 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  78.75 
 
 		 459 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  98.28 
 
 		 464 aa  938    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.19 
 
 		 458 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  951    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.88 
 
 		 448 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.88 
 
 		 448 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  64.88 
 
 		 448 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.84 
 
 		 447 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.22 
 
 		 448 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.4 
 
 		 446 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.45 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  62.86 
 
 		 448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.22 
 
 		 442 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  63.64 
 
 		 440 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.43 
 
 		 452 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.52 
 
 		 447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 		 446 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.42 
 
 		 446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.82 
 
 		 446 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  60.72 
 
 		 443 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.19 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.59 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.82 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  58.52 
 
 		 449 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.49 
 
 		 447 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  60.32 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.61 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  58.17 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  57.79 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  56.98 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  58.11 
 
 		 447 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.26 
 
 		 445 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.91 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.4 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  57.63 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.28 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  56.53 
 
 		 445 aa  528  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.77 
 
 		 440 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.95 
 
 		 439 aa  521  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  58.05 
 
 		 442 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  56.49 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  56.04 
 
 		 445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  57.6 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  55.43 
 
 		 470 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.95 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  55.95 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.95 
 
 		 470 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.29 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  55.29 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.07 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.65 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  55.48 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  55.65 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.88 
 
 		 473 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.33 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.66 
 
 		 449 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  55.16 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  54.09 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  56.36 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.31 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.96 
 
 		 457 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 		 466 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.31 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.73 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  51.94 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.51 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.51 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  54.44 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  54.29 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  54.07 
 
 		 466 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  54.22 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.85 
 
 		 466 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  53.53 
 
 		 440 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.2 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.81 
 
 		 442 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  52.88 
 
 		 453 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54 
 
 		 457 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.07 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.29 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  58.66 
 
 		 407 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.56 
 
 		 453 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  53.1 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.22 
 
 		 482 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  52.55 
 
 		 476 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  53.22 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  52.42 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.85 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.85 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.85 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  53.51 
 
 		 457 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.85 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  53.03 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.65 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.6 
 
 		 442 aa  477  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>