More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1936 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.88 
 
 		 453 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 450 aa  920    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  81.98 
 
 		 450 aa  751    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.75 
 
 		 450 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  75.66 
 
 		 451 aa  708    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  98 
 
 		 450 aa  906    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.21 
 
 		 452 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  60.72 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.85 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  60.27 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.93 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  59.46 
 
 		 439 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  58.69 
 
 		 441 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  58.61 
 
 		 443 aa  535  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  59.59 
 
 		 445 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.11 
 
 		 440 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.11 
 
 		 440 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  60.27 
 
 		 445 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.01 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  57.37 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  57.37 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  57.77 
 
 		 470 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.79 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.77 
 
 		 470 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  57.21 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.77 
 
 		 470 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  56.99 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  57.77 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.24 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.4 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  56.79 
 
 		 437 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  57.02 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.77 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.55 
 
 		 470 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  56.67 
 
 		 453 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  58.74 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.01 
 
 		 442 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  58.82 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  58.5 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  56.31 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  55.99 
 
 		 467 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.43 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 		 450 aa  524  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.77 
 
 		 454 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  57.33 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.8 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  56.56 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  57.77 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  55.66 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.66 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  55.77 
 
 		 470 aa  518  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  58.24 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.79 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  56.21 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  57.3 
 
 		 435 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  55.98 
 
 		 447 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.79 
 
 		 445 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.11 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.95 
 
 		 436 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  57.17 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  56.66 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.21 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.86 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.14 
 
 		 457 aa  512  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  55.99 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.25 
 
 		 463 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.79 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.31 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.34 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  56.08 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.79 
 
 		 446 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  57.79 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  55.22 
 
 		 457 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.21 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.85 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  55.68 
 
 		 445 aa  509  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.52 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.95 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  56.74 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  56.09 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  54.95 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  56.43 
 
 		 441 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  55.87 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.92 
 
 		 437 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  55.78 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.82 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.19 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.3 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  54.82 
 
 		 482 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.65 
 
 		 466 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.3 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  56.31 
 
 		 522 aa  502  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  55.51 
 
 		 448 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  55.51 
 
 		 448 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.46 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.33 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  55.56 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  54.48 
 
 		 448 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  55.51 
 
 		 448 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>