More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
494 aa  993    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  67.57 
 
 
443 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.93 
 
 
439 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.14 
 
 
442 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 
442 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 
442 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
439 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  60.55 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  60.73 
 
 
438 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.67 
 
 
490 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  59.59 
 
 
443 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.32 
 
 
475 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.74 
 
 
475 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.18 
 
 
444 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  60.32 
 
 
439 aa  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.95 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.94 
 
 
547 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  58.12 
 
 
437 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.72 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.47 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.47 
 
 
440 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 
439 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  55.31 
 
 
477 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.13 
 
 
495 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.08 
 
 
488 aa  482  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  58 
 
 
434 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  54.91 
 
 
452 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.17 
 
 
462 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  55.3 
 
 
440 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.24 
 
 
437 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  57.7 
 
 
443 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.45 
 
 
444 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.16 
 
 
440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  58.09 
 
 
439 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  54.3 
 
 
465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.32 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  59.36 
 
 
435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.99 
 
 
465 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.01 
 
 
454 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.69 
 
 
438 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.55 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
441 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  49.74 
 
 
434 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.66 
 
 
451 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.97 
 
 
438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
473 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.4 
 
 
441 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  39.32 
 
 
440 aa  329  6e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.63 
 
 
442 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.62 
 
 
453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.51 
 
 
434 aa  326  6e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.41 
 
 
442 aa  325  9e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  39.46 
 
 
448 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 
445 aa  325  1e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.83 
 
 
438 aa  325  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.99 
 
 
434 aa  323  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.65 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  40.83 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
443 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  38.98 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
438 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
440 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.53 
 
 
434 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
445 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.32 
 
 
438 aa  318  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.63 
 
 
440 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
453 aa  317  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  42.47 
 
 
434 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.38 
 
 
467 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  42.47 
 
 
434 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.65 
 
 
464 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.28 
 
 
445 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.56 
 
 
459 aa  316  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 
447 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.36 
 
 
440 aa  315  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.36 
 
 
440 aa  315  9e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.67 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  38.55 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.11 
 
 
478 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  38.57 
 
 
443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  39.29 
 
 
464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.46 
 
 
442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  39.91 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.56 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.46 
 
 
446 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
474 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 
447 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  39.55 
 
 
437 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.46 
 
 
437 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.38 
 
 
443 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  38.74 
 
 
440 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.79 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  39.54 
 
 
456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.91 
 
 
439 aa  310  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  37.87 
 
 
458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>