More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3192 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  76.96 
 
 		 477 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 452 aa  900    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.42 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.36 
 
 		 446 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  61.45 
 
 		 439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.46 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.5 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.5 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  60.64 
 
 		 443 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.82 
 
 		 442 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  57.44 
 
 		 437 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  57.24 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.93 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  57.24 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.78 
 
 		 439 aa  491  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.41 
 
 		 437 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  55.71 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  59.26 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.54 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  56.52 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  56.16 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  57.47 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.61 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  55.35 
 
 		 465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.68 
 
 		 444 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.03 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  53.83 
 
 		 440 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.68 
 
 		 488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.93 
 
 		 490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.18 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.85 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  56.65 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.98 
 
 		 475 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.2 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  57.31 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.13 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  48.79 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.22 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.57 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  52.23 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.07 
 
 		 441 aa  358  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.72 
 
 		 438 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.27 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.83 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 		 446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.06 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.84 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.83 
 
 		 434 aa  333  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 		 438 aa  333  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.38 
 
 		 462 aa  329  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.11 
 
 		 473 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.84 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  42.66 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.31 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 		 452 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.76 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.23 
 
 		 442 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.69 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.23 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.59 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  41.27 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.54 
 
 		 435 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.54 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.2 
 
 		 463 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.64 
 
 		 438 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39 
 
 		 451 aa  322  8e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.05 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 		 438 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.32 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  40.69 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  40.13 
 
 		 454 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.43 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.69 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  35.75 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.13 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 		 438 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  42.63 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  39.69 
 
 		 454 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  42.63 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.6 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.82 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.1 
 
 		 437 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>