More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0495 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0495  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  886    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.156569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.59 
 
 
440 aa  617  1e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.45 
 
 
441 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0603  nucleotide sugar dehydrogenase  60 
 
 
441 aa  528  1e-149  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0685216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.42 
 
 
906 aa  361  1e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0697467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 
436 aa  352  8e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  43.89 
 
 
427 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
440 aa  334  2e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
443 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  39.24 
 
 
427 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.29 
 
 
460 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.26 
 
 
441 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.62 
 
 
442 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.98 
 
 
439 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  37.61 
 
 
470 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37 
 
 
438 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  36.89 
 
 
446 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  38.88 
 
 
434 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.89 
 
 
446 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.24 
 
 
466 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.24 
 
 
466 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  35.96 
 
 
466 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0911  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.56 
 
 
449 aa  317  4e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  36.24 
 
 
466 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 
437 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  37.25 
 
 
437 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  38.65 
 
 
434 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  36.62 
 
 
466 aa  316  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
445 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1104  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.33 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.75 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  36.73 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.55 
 
 
446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.34 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.12 
 
 
437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.57 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.81 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  35.48 
 
 
440 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  36.4 
 
 
467 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
466 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  40.67 
 
 
440 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  36.89 
 
 
440 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
436 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  36.28 
 
 
445 aa  311  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
436 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  36.95 
 
 
470 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.4 
 
 
467 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.95 
 
 
470 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
435 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.95 
 
 
470 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.24 
 
 
450 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.19 
 
 
445 aa  310  4e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  37.98 
 
 
437 aa  309  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.67 
 
 
444 aa  310  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.72 
 
 
466 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
442 aa  310  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.75 
 
 
453 aa  310  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  37.03 
 
 
440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.12 
 
 
435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.02 
 
 
442 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  38.79 
 
 
436 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.34 
 
 
453 aa  308  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  35.25 
 
 
445 aa  308  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
466 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  36.83 
 
 
438 aa  308  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  36.59 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.85 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.28 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  36.64 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.62 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.59 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.59 
 
 
473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.24 
 
 
438 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  35.7 
 
 
445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  37.39 
 
 
482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  36.24 
 
 
435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.19 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.9 
 
 
440 aa  306  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.16 
 
 
450 aa  306  7e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  35.62 
 
 
450 aa  306  7e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  35.67 
 
 
437 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  35.67 
 
 
437 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.97 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  37.28 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.73 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  36.47 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.57 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.57 
 
 
503 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.22 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.75 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.75 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.87 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>