More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0413 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
440 aa  876    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0495  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.59 
 
 
440 aa  617  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.156569  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0603  nucleotide sugar dehydrogenase  61.31 
 
 
441 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0685216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1350  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.09 
 
 
441 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000563405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.97 
 
 
460 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.92 
 
 
906 aa  354  1e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0697467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  38.6 
 
 
435 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.15 
 
 
436 aa  352  8e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  38.37 
 
 
436 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.4 
 
 
443 aa  349  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
466 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.25 
 
 
438 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
466 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
466 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  39.74 
 
 
466 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  341  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  37.31 
 
 
450 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.25 
 
 
467 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  42.18 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 
459 aa  339  7e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  36.79 
 
 
437 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  38.82 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.6 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  40.89 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  36.57 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  40.81 
 
 
436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  38.38 
 
 
466 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  39.74 
 
 
453 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.06 
 
 
440 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  38.75 
 
 
441 aa  333  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.98 
 
 
442 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 
440 aa  332  8e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
466 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  37.92 
 
 
446 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  38.83 
 
 
446 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  37.36 
 
 
449 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.14 
 
 
446 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.44 
 
 
442 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  38.36 
 
 
445 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  38.77 
 
 
476 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.38 
 
 
466 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.94 
 
 
447 aa  330  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  39.42 
 
 
438 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  41.22 
 
 
437 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  38.53 
 
 
443 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  38.39 
 
 
445 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  38.38 
 
 
470 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
472 aa  329  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
435 aa  329  7e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
445 aa  329  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.33 
 
 
503 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  38.72 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  37.69 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  38.27 
 
 
466 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  38.57 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.73 
 
 
453 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
470 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.34 
 
 
437 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.31 
 
 
447 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.69 
 
 
466 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.95 
 
 
442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  37.42 
 
 
453 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.63 
 
 
454 aa  326  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
437 aa  326  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
437 aa  326  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  37.95 
 
 
442 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.58 
 
 
447 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.25 
 
 
440 aa  325  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.25 
 
 
440 aa  325  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.08 
 
 
452 aa  325  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  38.27 
 
 
454 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.72 
 
 
442 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 
470 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  38.57 
 
 
441 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  37.5 
 
 
450 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  37.83 
 
 
482 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.5 
 
 
470 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.97 
 
 
453 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.5 
 
 
457 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
436 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
429 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.19 
 
 
457 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.64 
 
 
439 aa  323  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  37.83 
 
 
470 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.87 
 
 
446 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.8 
 
 
440 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.69 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  37.69 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.69 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>