More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5424 on replicon NC_010181
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  78.79 
 
 
428 aa  700    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
429 aa  880    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  53.97 
 
 
427 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  43.12 
 
 
427 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.06 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.04 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  41.15 
 
 
446 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.19 
 
 
437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
438 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.84 
 
 
438 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
434 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.84 
 
 
438 aa  350  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.68 
 
 
441 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
442 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.15 
 
 
434 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.23 
 
 
440 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  39.6 
 
 
449 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  39.6 
 
 
449 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  39.57 
 
 
463 aa  345  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
457 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.92 
 
 
434 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.46 
 
 
433 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.14 
 
 
443 aa  344  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  38.97 
 
 
464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.58 
 
 
462 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  41.97 
 
 
440 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.82 
 
 
435 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
438 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.68 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 
435 aa  340  4e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.41 
 
 
436 aa  339  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 
460 aa  338  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.24 
 
 
436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  41.32 
 
 
470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.73 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  40.88 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.87 
 
 
437 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  335  5.999999999999999e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.14 
 
 
439 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  40.95 
 
 
436 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.46 
 
 
452 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  40.31 
 
 
482 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 
463 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.66 
 
 
482 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 
434 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.39 
 
 
459 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  40.26 
 
 
466 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 
467 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  40.05 
 
 
439 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 
466 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 
466 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  41.12 
 
 
431 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  39.65 
 
 
467 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.04 
 
 
472 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.88 
 
 
470 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
450 aa  332  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  39.82 
 
 
466 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.61 
 
 
466 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
475 aa  332  9e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
434 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.65 
 
 
457 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  36.97 
 
 
450 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  38.22 
 
 
456 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  39.61 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  39.72 
 
 
459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 
434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  39.65 
 
 
454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.23 
 
 
436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 
457 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 
435 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.29 
 
 
473 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.5 
 
 
438 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  38.1 
 
 
447 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
462 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 
442 aa  326  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.42 
 
 
471 aa  326  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.87 
 
 
447 aa  325  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  38.22 
 
 
450 aa  325  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.22 
 
 
439 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.64 
 
 
453 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.45 
 
 
436 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  37.78 
 
 
466 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.59 
 
 
456 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
462 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.58 
 
 
443 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 
441 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.8 
 
 
456 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  39.25 
 
 
454 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.14 
 
 
442 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>