More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2649 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 467 aa  954    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  54.34 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.56 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  47.83 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  47.83 
 
 		 449 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  46.91 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.74 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  47.48 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.92 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.15 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  46.11 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  45.47 
 
 		 463 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  46.76 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.36 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  42.86 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  44.93 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.21 
 
 		 457 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  45.06 
 
 		 458 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.77 
 
 		 457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.55 
 
 		 451 aa  356  5e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.31 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  45.7 
 
 		 449 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  46.1 
 
 		 434 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  46.01 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.53 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.22 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.62 
 
 		 436 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  41.28 
 
 		 443 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  46.22 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.74 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.5 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.33 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  45.39 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.02 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  45.39 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  46.1 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.16 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  43.01 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  43.96 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  46.22 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.14 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  44.98 
 
 		 434 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.41 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.58 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.98 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.35 
 
 		 437 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.04 
 
 		 462 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.72 
 
 		 450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.14 
 
 		 390 aa  339  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.04 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  40 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.1 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.12 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  44.04 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.82 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.54 
 
 		 453 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  44.39 
 
 		 456 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.96 
 
 		 438 aa  336  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.36 
 
 		 462 aa  335  9e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  44.14 
 
 		 437 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  44.13 
 
 		 431 aa  335  9e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  41.15 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  43.25 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  42.31 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.44 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  43.91 
 
 		 437 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.04 
 
 		 456 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  43.74 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  42.99 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.59 
 
 		 456 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.54 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  45.08 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 		 450 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  43.25 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.2 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.71 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.39 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  46 
 
 		 463 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  42.86 
 
 		 449 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.86 
 
 		 452 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  45.31 
 
 		 452 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  43.28 
 
 		 448 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.6 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.02 
 
 		 433 aa  329  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.14 
 
 		 456 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  40.38 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  42.66 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.81 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>