More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1210 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.27 
 
 		 457 aa  683    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  76.1 
 
 		 457 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 430 aa  880    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  75.17 
 
 		 458 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  72.62 
 
 		 458 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.65 
 
 		 451 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  61.63 
 
 		 449 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  53.02 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  50.23 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  46.39 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.94 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.94 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.98 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.74 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  45.73 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.98 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  45.96 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.98 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.28 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.74 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.28 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  47.29 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  46.94 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.21 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  47 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.51 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  46.71 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  47.7 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.74 
 
 		 450 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.81 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  45.93 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  46.92 
 
 		 448 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.96 
 
 		 437 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.67 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  45.91 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  45.64 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  44.24 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  46.92 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.83 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.9 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.85 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  45.7 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  45 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.68 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  44.39 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.82 
 
 		 450 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.48 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.75 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  46.08 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  43.82 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  45.12 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  46.08 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 		 436 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  46.44 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.84 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  45.27 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.04 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.64 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.62 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  46.1 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  43.55 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.94 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  43.96 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  44.9 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  43.21 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  43.21 
 
 		 449 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.83 
 
 		 436 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.83 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.87 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.56 
 
 		 448 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  45.77 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.32 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.52 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.86 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  45.29 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  43.79 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  44.19 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.57 
 
 		 452 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.29 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.28 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.15 
 
 		 440 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.74 
 
 		 451 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.06 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.19 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.87 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.14 
 
 		 434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  43.08 
 
 		 445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.77 
 
 		 447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.96 
 
 		 442 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  43.22 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  44.75 
 
 		 434 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  42.83 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  45.56 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  43.51 
 
 		 443 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>