More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1081 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
425 aa  868    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.35 
 
 
425 aa  545  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.24 
 
 
421 aa  535  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.71 
 
 
428 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.15 
 
 
426 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.58 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  47.7 
 
 
429 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  47.48 
 
 
431 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  46.8 
 
 
432 aa  360  2e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.25 
 
 
309 aa  348  8e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  41.99 
 
 
486 aa  346  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  43.47 
 
 
427 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  45.56 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  45.8 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  45.18 
 
 
443 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.19 
 
 
424 aa  331  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  42.51 
 
 
451 aa  329  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.78 
 
 
462 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.55 
 
 
462 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.78 
 
 
456 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.06 
 
 
441 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  43.71 
 
 
459 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.55 
 
 
462 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  43.75 
 
 
440 aa  323  3e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.75 
 
 
460 aa  323  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.78 
 
 
456 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.84 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.87 
 
 
441 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.15 
 
 
443 aa  319  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.63 
 
 
441 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.66 
 
 
456 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  43.09 
 
 
427 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  42.45 
 
 
438 aa  317  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
456 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.79 
 
 
447 aa  315  8e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.61 
 
 
451 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.93 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  42.39 
 
 
458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.95 
 
 
472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.22 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
466 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.93 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.03 
 
 
443 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  42.96 
 
 
440 aa  310  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.15 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.49 
 
 
436 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
436 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
435 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.08 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.22 
 
 
442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 
459 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  42.35 
 
 
522 aa  305  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  40.57 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
450 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.52 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.27 
 
 
457 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
450 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
449 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
449 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.17 
 
 
453 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  40.58 
 
 
464 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 
438 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.26 
 
 
438 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 
448 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.93 
 
 
450 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  40.57 
 
 
437 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  40.8 
 
 
437 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.33 
 
 
434 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  40.33 
 
 
434 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  40.19 
 
 
438 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 
402 aa  300  4e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.07 
 
 
467 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.23 
 
 
434 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.45 
 
 
442 aa  299  7e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.87 
 
 
440 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  41.04 
 
 
434 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 
434 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
458 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  41.45 
 
 
440 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.42 
 
 
438 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.22 
 
 
436 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  40.71 
 
 
437 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 
435 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  42 
 
 
445 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  41.04 
 
 
434 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.49 
 
 
442 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  40.78 
 
 
441 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  41.07 
 
 
449 aa  296  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>