More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1505 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
424 aa  835    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
426 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.22 
 
 
428 aa  354  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.45 
 
 
425 aa  350  4e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  43.85 
 
 
446 aa  349  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.69 
 
 
431 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.21 
 
 
421 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  43.08 
 
 
475 aa  329  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  40.82 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.76 
 
 
436 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  41.97 
 
 
453 aa  322  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 
440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.59 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  43.53 
 
 
436 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  44 
 
 
435 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 
447 aa  318  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.4 
 
 
443 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.01 
 
 
460 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
444 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  43.41 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.41 
 
 
434 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.53 
 
 
440 aa  312  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.66 
 
 
438 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  42.62 
 
 
440 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.94 
 
 
451 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.75 
 
 
441 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.94 
 
 
442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  43.66 
 
 
466 aa  308  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.36 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  41.81 
 
 
522 aa  307  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.19 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  38.21 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  42.13 
 
 
429 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.43 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
470 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.79 
 
 
438 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.49 
 
 
470 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.49 
 
 
470 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.26 
 
 
470 aa  305  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.72 
 
 
440 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.72 
 
 
440 aa  305  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  41.2 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.5 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 
434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  41.47 
 
 
447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.94 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.52 
 
 
445 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 
473 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.41 
 
 
434 aa  302  9e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  43.11 
 
 
439 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 
438 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.92 
 
 
452 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.71 
 
 
439 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 
438 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.61 
 
 
447 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  41.27 
 
 
453 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.39 
 
 
463 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.47 
 
 
456 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.23 
 
 
439 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  40.19 
 
 
451 aa  299  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.63 
 
 
402 aa  299  6e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.66 
 
 
438 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.22 
 
 
453 aa  298  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.42 
 
 
434 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.69 
 
 
462 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.8 
 
 
434 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 
438 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.96 
 
 
434 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.82 
 
 
450 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.61 
 
 
433 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 
436 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  38.84 
 
 
449 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.18 
 
 
434 aa  296  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  38.84 
 
 
449 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
438 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.17 
 
 
473 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  38.44 
 
 
457 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.66 
 
 
450 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  37.14 
 
 
435 aa  295  8e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.17 
 
 
473 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  40.43 
 
 
448 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  42.17 
 
 
473 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  40.19 
 
 
445 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
450 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.61 
 
 
440 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.06 
 
 
456 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
440 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
442 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.32 
 
 
467 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.95 
 
 
471 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.63 
 
 
445 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  38.15 
 
 
450 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.33 
 
 
448 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>