More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1430 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
431 aa  856    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  70.97 
 
 
432 aa  565  1e-160  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  64.43 
 
 
429 aa  534  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  56.97 
 
 
486 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.49 
 
 
431 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.81 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.63 
 
 
421 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.54 
 
 
426 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.85 
 
 
428 aa  381  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.27 
 
 
425 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.17 
 
 
459 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.87 
 
 
451 aa  335  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.99 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  39.81 
 
 
427 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  42.22 
 
 
449 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  42.22 
 
 
449 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.6 
 
 
459 aa  315  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  41.48 
 
 
464 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  42.15 
 
 
443 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  41.91 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  41.31 
 
 
466 aa  309  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.38 
 
 
462 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  42.89 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
472 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 
438 aa  306  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  43.09 
 
 
433 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.51 
 
 
442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.68 
 
 
424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  39.72 
 
 
443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  42.73 
 
 
434 aa  305  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 
453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  42.5 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  41.36 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  42.62 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.22 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  40.19 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  44.02 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.34 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  39.73 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.18 
 
 
503 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.92 
 
 
439 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.96 
 
 
450 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.92 
 
 
434 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  40.34 
 
 
463 aa  301  1e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.73 
 
 
433 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  43.61 
 
 
456 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  40.87 
 
 
453 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.47 
 
 
309 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.19 
 
 
442 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
438 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.47 
 
 
463 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.04 
 
 
433 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 
452 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.63 
 
 
467 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.27 
 
 
447 aa  298  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.45 
 
 
436 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.98 
 
 
438 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  42.15 
 
 
449 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.05 
 
 
443 aa  296  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  39.72 
 
 
458 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 
438 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  39.43 
 
 
475 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.47 
 
 
471 aa  295  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  37.53 
 
 
489 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.01 
 
 
445 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.4 
 
 
437 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  41.55 
 
 
522 aa  293  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  39.81 
 
 
437 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.14 
 
 
437 aa  292  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.14 
 
 
437 aa  292  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.28 
 
 
451 aa  292  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.52 
 
 
447 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  42.59 
 
 
436 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.4 
 
 
478 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.53 
 
 
440 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.53 
 
 
440 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.92 
 
 
436 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  42.49 
 
 
445 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.82 
 
 
438 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  38.03 
 
 
435 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.37 
 
 
435 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.76 
 
 
451 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.17 
 
 
442 aa  289  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  40.64 
 
 
427 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  42.29 
 
 
473 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.14 
 
 
438 aa  288  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
470 aa  288  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.85 
 
 
473 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 
482 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.45 
 
 
440 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.77 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.65 
 
 
404 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>