More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1719 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
447 aa  892    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  41.5 
 
 
440 aa  352  7e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.6 
 
 
431 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 
427 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.94 
 
 
426 aa  340  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.66 
 
 
460 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  41.5 
 
 
449 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  41.5 
 
 
449 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 
443 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 
457 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 
464 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.52 
 
 
471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.56 
 
 
428 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  39.64 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  39.64 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.78 
 
 
462 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 
446 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.44 
 
 
439 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 
440 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  39.7 
 
 
463 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.88 
 
 
425 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  39.22 
 
 
475 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.34 
 
 
433 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.67 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.67 
 
 
424 aa  312  9e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 
434 aa  312  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.53 
 
 
440 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.61 
 
 
421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.54 
 
 
433 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
472 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
447 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 
434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.31 
 
 
436 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.37 
 
 
450 aa  306  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.99 
 
 
433 aa  306  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.04 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.19 
 
 
451 aa  305  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.09 
 
 
434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0413  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.88 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.394208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.59 
 
 
438 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  39.01 
 
 
450 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 
434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.41 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  37.16 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.86 
 
 
442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.12 
 
 
436 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.07 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  38.57 
 
 
450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  39.15 
 
 
451 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  40.27 
 
 
427 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
438 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.36 
 
 
434 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0718  nucleotide sugar dehydrogenase  39.68 
 
 
433 aa  302  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 
438 aa  301  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  39.56 
 
 
441 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  37.41 
 
 
443 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 
436 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 
438 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  39.46 
 
 
449 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 
434 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.93 
 
 
450 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  37.84 
 
 
453 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.76 
 
 
435 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
452 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 
434 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  38.51 
 
 
436 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 
436 aa  299  6e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.55 
 
 
467 aa  299  7e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  38.51 
 
 
435 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  38.51 
 
 
466 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  37.92 
 
 
459 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  37.81 
 
 
450 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  36.65 
 
 
440 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
478 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  38.46 
 
 
445 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  38.86 
 
 
489 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 
456 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 
436 aa  296  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.41 
 
 
442 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 
437 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 
449 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 
463 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  38.83 
 
 
439 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.62 
 
 
438 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37 
 
 
428 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  38.53 
 
 
441 aa  293  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  38.69 
 
 
441 aa  293  6e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 
447 aa  292  9e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
435 aa  290  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.33 
 
 
439 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.79 
 
 
434 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  38.2 
 
 
448 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 
459 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.88 
 
 
448 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  41.27 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.06 
 
 
440 aa  289  6e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  38.03 
 
 
450 aa  289  6e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.08 
 
 
456 aa  289  7e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>