More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1120 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1120  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 309 aa  629  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.45 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.96 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.14 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.37 
 
 		 426 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.29 
 
 		 428 aa  353  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.25 
 
 		 425 aa  349  4e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 		 432 aa  291  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  47.47 
 
 		 431 aa  288  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  45.4 
 
 		 429 aa  285  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  44.22 
 
 		 427 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  44.55 
 
 		 486 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  46.04 
 
 		 451 aa  264  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.66 
 
 		 447 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.94 
 
 		 443 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  44.84 
 
 		 446 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  47.12 
 
 		 431 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 		 441 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 		 462 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 		 462 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  45.32 
 
 		 443 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.71 
 
 		 456 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.36 
 
 		 462 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  45.36 
 
 		 456 aa  244  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0973  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.05 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00533761  normal  0.376368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.96 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.64 
 
 		 456 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.96 
 
 		 438 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.4 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.34 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.73 
 
 		 462 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.29 
 
 		 441 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.51 
 
 		 438 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  43.84 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.7 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  43.84 
 
 		 434 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  42.61 
 
 		 466 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.95 
 
 		 438 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.87 
 
 		 424 aa  236  3e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.11 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.11 
 
 		 435 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.64 
 
 		 467 aa  235  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.86 
 
 		 456 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.27 
 
 		 460 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  45.64 
 
 		 440 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.46 
 
 		 440 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  42.18 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.84 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.34 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.75 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.25 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  42.65 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.61 
 
 		 452 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  41.83 
 
 		 449 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.96 
 
 		 436 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  41.83 
 
 		 449 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  47.23 
 
 		 437 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  42.03 
 
 		 463 aa  232  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  47.23 
 
 		 437 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  43.3 
 
 		 451 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  43.46 
 
 		 464 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.95 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.56 
 
 		 448 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  45.36 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  45.3 
 
 		 440 aa  230  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.48 
 
 		 440 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.21 
 
 		 434 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.38 
 
 		 478 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  45.79 
 
 		 438 aa  230  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.26 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.83 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  41.12 
 
 		 445 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  44.16 
 
 		 522 aa  229  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.4 
 
 		 478 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.21 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.58 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.1 
 
 		 436 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.49 
 
 		 438 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.49 
 
 		 438 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.44 
 
 		 435 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  40.85 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  40.56 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  39.24 
 
 		 456 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 		 450 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  41.25 
 
 		 449 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.72 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.75 
 
 		 447 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  41.72 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  41.72 
 
 		 448 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.72 
 
 		 452 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.1 
 
 		 436 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  42.65 
 
 		 450 aa  226  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.09 
 
 		 438 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  39.51 
 
 		 442 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  42.76 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  42.12 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.72 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.52 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>