More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1810 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1810  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 402 aa  811    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  44.8 
 
 		 434 aa  328  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  44.57 
 
 		 434 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  45.16 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  44.8 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  44.8 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  44.93 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.11 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  43.16 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  43.88 
 
 		 442 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  44.47 
 
 		 433 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  43.65 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  44.11 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  43.94 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  44.7 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.27 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  43.02 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  43.65 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  45.34 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.4 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  43.4 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.2 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  43.68 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.45 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2649  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 		 467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  44.39 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.79 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.76 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44 
 
 		 436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.65 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.73 
 
 		 440 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.94 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.36 
 
 		 436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.52 
 
 		 451 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.61 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.47 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.47 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  40.4 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  40.4 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.36 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  40.97 
 
 		 475 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  40.95 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  40.95 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 		 435 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2782  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.73 
 
 		 457 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 		 443 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.96 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  42.3 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.29 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  41.71 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.12 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.38 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.88 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  41.41 
 
 		 427 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.61 
 
 		 462 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.27 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.2 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.68 
 
 		 457 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 		 449 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.52 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.96 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  40.9 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.71 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  39.44 
 
 		 458 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  38.66 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.48 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  41.96 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  38.93 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.46 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.32 
 
 		 467 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.14 
 
 		 478 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.58 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.93 
 
 		 459 aa  289  7e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  41.07 
 
 		 438 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 		 442 aa  288  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  39.95 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.82 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.63 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.67 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.72 
 
 		 425 aa  285  8e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.42 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.8 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.22 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.5 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  39.04 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  37.47 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.14 
 
 		 438 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.57 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.65 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  41.41 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  41.41 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  38.86 
 
 		 440 aa  280  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>