More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5882 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
437 aa  895    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  52.27 
 
 
438 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  49.54 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  49.09 
 
 
436 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  47.72 
 
 
438 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.26 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.6 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.26 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  47.26 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  49.64 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  47.26 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.49 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.26 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  47.03 
 
 
438 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  45.89 
 
 
438 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  46.62 
 
 
429 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  42.79 
 
 
469 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 
447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.35 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 
420 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.08 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.1 
 
 
419 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  37.3 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.28 
 
 
447 aa  242  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.55 
 
 
428 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.79 
 
 
426 aa  237  4e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  35.43 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.92 
 
 
424 aa  234  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  40.28 
 
 
431 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.72 
 
 
460 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.25 
 
 
425 aa  227  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.98 
 
 
425 aa  227  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  35.49 
 
 
427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  37.01 
 
 
449 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  37.01 
 
 
449 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  37.47 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  34.88 
 
 
486 aa  220  3e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  36.36 
 
 
522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.2 
 
 
471 aa  219  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 
453 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  35.96 
 
 
446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39 
 
 
421 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  37.03 
 
 
445 aa  216  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  35.93 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
434 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.84 
 
 
434 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  34.73 
 
 
459 aa  216  8e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.94 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  36.94 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  36.32 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.8 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  34.23 
 
 
434 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
428 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  34.23 
 
 
434 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.36 
 
 
462 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.5 
 
 
440 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  36.55 
 
 
451 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  35.75 
 
 
463 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.87 
 
 
467 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.47 
 
 
437 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5366  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.75 
 
 
456 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  34.44 
 
 
443 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  31.22 
 
 
440 aa  207  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
457 aa  206  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5638  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.03 
 
 
441 aa  206  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000154055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.31 
 
 
457 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  37.78 
 
 
441 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.76 
 
 
445 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.29 
 
 
440 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.61 
 
 
445 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.49 
 
 
456 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5434  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.47 
 
 
441 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.14 
 
 
434 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.02 
 
 
434 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  34.01 
 
 
475 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5049  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.47 
 
 
462 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4894  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.47 
 
 
462 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  37.33 
 
 
447 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  34.44 
 
 
430 aa  204  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  37.74 
 
 
464 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5290  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.47 
 
 
456 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000221682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.75 
 
 
456 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  35.97 
 
 
441 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  32.95 
 
 
445 aa  203  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  36.84 
 
 
445 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  35.29 
 
 
435 aa  202  8e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  33.11 
 
 
466 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  32.45 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4879  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.92 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.02 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  36.34 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  34.61 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.25 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  34.93 
 
 
458 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  35.52 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5321  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.47 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  36.07 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.52 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.52 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.81 
 
 
467 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>