More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0889 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  899    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  96.8 
 
 		 438 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  84.7 
 
 		 438 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  78.08 
 
 		 439 aa  716    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  81.05 
 
 		 436 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  84.7 
 
 		 438 aa  778    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  85.84 
 
 		 438 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 		 436 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  97.03 
 
 		 438 aa  879    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  96.58 
 
 		 438 aa  871    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  74.43 
 
 		 436 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  78.31 
 
 		 436 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  55.24 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  49.64 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.38 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  45.73 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.7 
 
 		 469 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  43.06 
 
 		 447 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.05 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 		 420 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.67 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.43 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.21 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.02 
 
 		 419 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.2 
 
 		 425 aa  255  9e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.29 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  39.05 
 
 		 429 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.34 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  38.73 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.92 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.38 
 
 		 463 aa  239  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  35.01 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  35.41 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.26 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  36.8 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.84 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.4 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.76 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.84 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.3 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 		 429 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  38.94 
 
 		 457 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  33.41 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  35.44 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  35.22 
 
 		 451 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  34.15 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.68 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  33.81 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.9 
 
 		 446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  34.61 
 
 		 449 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.78 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  37.33 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  35.99 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.38 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.53 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.72 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.05 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.77 
 
 		 448 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.04 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  37.33 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  33.99 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1843  nucleotide sugar dehydrogenase  35.81 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000229884  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  34.96 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.97 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.97 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.83 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  35.5 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.01 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.75 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.1 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  36.41 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  33.41 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  34.22 
 
 		 448 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.38 
 
 		 442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.64 
 
 		 440 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.77 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  35.47 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.22 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.82 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.21 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.26 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  34.11 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  33.8 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.41 
 
 		 446 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  33.8 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.72 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  35.73 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  35.44 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  35.44 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  33.09 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.67 
 
 		 457 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.32 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  35.39 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  35.28 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.88 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  35.58 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.16 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>