More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0673 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  895    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  50.57 
 
 		 439 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  50.57 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  50.68 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.06 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  48.4 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.84 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.61 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  47.61 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.61 
 
 		 438 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  47.84 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  48.63 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  47.38 
 
 		 438 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  45.89 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  45.79 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  44.05 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  41.49 
 
 		 447 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.32 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.8 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  36.81 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.11 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  37.97 
 
 		 419 aa  259  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.58 
 
 		 451 aa  235  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.58 
 
 		 426 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  36.13 
 
 		 453 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.57 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  37.64 
 
 		 450 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  35.81 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  35.42 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.82 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.51 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.99 
 
 		 443 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  34.73 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  34.73 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.15 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  35.15 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.88 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  34.87 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.87 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.54 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.15 
 
 		 473 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.5 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.07 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  34.9 
 
 		 441 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  34.36 
 
 		 427 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  34.24 
 
 		 451 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 470 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  35.05 
 
 		 470 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 470 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.5 
 
 		 470 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  33.42 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1936  nucleotide sugar dehydrogenase  33.24 
 
 		 450 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  33.01 
 
 		 486 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.22 
 
 		 450 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2287  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  34.52 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.42 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  34.52 
 
 		 437 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.34 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  36.12 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  35.08 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.07 
 
 		 460 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.07 
 
 		 438 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.94 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.25 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  33.79 
 
 		 522 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  34.33 
 
 		 482 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.85 
 
 		 462 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  34.44 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  34.44 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.16 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.54 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.16 
 
 		 453 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.54 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  35.44 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  34.92 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  34.23 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  35.54 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  32.48 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.51 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  34.38 
 
 		 450 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 		 430 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.78 
 
 		 450 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.57 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.7 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.06 
 
 		 445 aa  202  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  34.5 
 
 		 470 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  31.42 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.44 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.25 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  32.21 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 		 440 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.24 
 
 		 440 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  33.07 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  33.52 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.98 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3605  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>