More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3605 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3605  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  909    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.62 
 
 
443 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.76 
 
 
438 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  42.45 
 
 
427 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.19 
 
 
434 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.96 
 
 
436 aa  362  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3213  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.62 
 
 
503 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.46 
 
 
440 aa  359  5e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.25 
 
 
438 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  43.5 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41.92 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 
449 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 
449 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.41 
 
 
436 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  42.45 
 
 
437 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.45 
 
 
438 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.41 
 
 
436 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  42.45 
 
 
437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  42.45 
 
 
434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.41 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 
433 aa  352  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.85 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.34 
 
 
460 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.02 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.55 
 
 
434 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.61 
 
 
442 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  42.25 
 
 
440 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  42.21 
 
 
434 aa  351  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  41.97 
 
 
439 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  39.34 
 
 
462 aa  349  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  42.07 
 
 
438 aa  348  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.49 
 
 
434 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  41.13 
 
 
459 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.31 
 
 
436 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.45 
 
 
437 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 
436 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.82 
 
 
437 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.74 
 
 
440 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.74 
 
 
440 aa  346  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  44.16 
 
 
457 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  39.39 
 
 
464 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.28 
 
 
459 aa  345  8.999999999999999e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  41.28 
 
 
450 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.02 
 
 
434 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  43.22 
 
 
449 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2042  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.76 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.08 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.15 
 
 
474 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 
447 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.03 
 
 
452 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  38.89 
 
 
457 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41.35 
 
 
438 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.91 
 
 
474 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.98 
 
 
438 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41.35 
 
 
438 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.87 
 
 
471 aa  341  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.08 
 
 
434 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  40.85 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.78 
 
 
463 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  40.61 
 
 
433 aa  338  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.77 
 
 
435 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  42.01 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
436 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.49 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.24 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  39.07 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.44 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  39.07 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.13 
 
 
439 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  41.28 
 
 
473 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2628  nucleotide sugar dehydrogenase  37.47 
 
 
463 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 
440 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
434 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.85 
 
 
434 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
433 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  42.82 
 
 
431 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.55 
 
 
434 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.53 
 
 
442 aa  333  5e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  40.22 
 
 
475 aa  332  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.73 
 
 
472 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  42.86 
 
 
464 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41 
 
 
450 aa  332  9e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.95 
 
 
453 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0620  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.99 
 
 
435 aa  331  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0934466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 
438 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  39.16 
 
 
435 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.72 
 
 
437 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  40.47 
 
 
443 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.91 
 
 
438 aa  329  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.35 
 
 
447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  39.51 
 
 
453 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  40.76 
 
 
450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  40.85 
 
 
437 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  39.19 
 
 
454 aa  325  7e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  40.23 
 
 
448 aa  325  9e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.51 
 
 
444 aa  325  9e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 
467 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  42.15 
 
 
442 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  40.61 
 
 
436 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.37 
 
 
478 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0278162  normal  0.412621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>