More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1678 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  74.66 
 
 		 438 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  74.43 
 
 		 438 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  78.67 
 
 		 436 aa  725    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 436 aa  891    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  75.57 
 
 		 438 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  73.97 
 
 		 438 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  75.57 
 
 		 438 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  79.59 
 
 		 439 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.97 
 
 		 438 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  72.94 
 
 		 436 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  79.36 
 
 		 436 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  74.43 
 
 		 438 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  51.81 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  47.6 
 
 		 437 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  48.4 
 
 		 438 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  46.51 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.02 
 
 		 469 aa  360  4e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  43.47 
 
 		 447 aa  342  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.59 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  39.62 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.43 
 
 		 451 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.96 
 
 		 431 aa  280  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.94 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.43 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 		 419 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.56 
 
 		 425 aa  246  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  38.2 
 
 		 431 aa  243  6e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.32 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.24 
 
 		 424 aa  240  4e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  37.27 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  37.85 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.82 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  35.85 
 
 		 445 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.88 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.11 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.85 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.62 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.27 
 
 		 429 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  34.31 
 
 		 448 aa  229  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  37.15 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1081  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.79 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.151094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.84 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.06 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  36.64 
 
 		 453 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.73 
 
 		 446 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  34.73 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  33.81 
 
 		 449 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.67 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.98 
 
 		 450 aa  226  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  34.63 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.71 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.33 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  33.71 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  33.71 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.98 
 
 		 471 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  36.05 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.16 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  36.69 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.66 
 
 		 447 aa  220  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  34.16 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.81 
 
 		 467 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  35.39 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  35.98 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  33.98 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.92 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  35.64 
 
 		 473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.29 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  34.24 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.81 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  34.58 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.18 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.74 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.85 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.43 
 
 		 434 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.73 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.92 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  34.73 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1850  nucleotide sugar dehydrogenase  35.23 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.85 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.19 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  35.36 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  36.99 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.74 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.82 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4614  nucleotide sugar dehydrogenase  37.05 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  33.01 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.98 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4589  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.81 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.1 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  32.16 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.13 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  37.95 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.13 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.63 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  36.29 
 
 		 436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  35.38 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.92 
 
 		 445 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.29 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>