More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1699 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  100 
 
 
419 aa  857    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  58.81 
 
 
420 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  57.24 
 
 
421 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.69 
 
 
438 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.91 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.6 
 
 
436 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  40.21 
 
 
439 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  40.21 
 
 
436 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.19 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.86 
 
 
438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.79 
 
 
438 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  38.1 
 
 
437 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.53 
 
 
438 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.28 
 
 
438 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  38.69 
 
 
438 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.02 
 
 
438 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  39.02 
 
 
438 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  38.07 
 
 
436 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  40.2 
 
 
447 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  37.97 
 
 
438 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.11 
 
 
469 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.26 
 
 
425 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.63 
 
 
428 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.94 
 
 
428 aa  209  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.46 
 
 
431 aa  206  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.45 
 
 
426 aa  205  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1642  nucleotide sugar dehydrogenase  32.2 
 
 
427 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1210  nucleotide sugar dehydrogenase  34.45 
 
 
430 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 
446 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5424  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.26 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  33.98 
 
 
449 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
457 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  30.54 
 
 
466 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  31.77 
 
 
440 aa  193  4e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.06 
 
 
445 aa  193  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  31.4 
 
 
443 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.02 
 
 
421 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0769  nucleotide sugar dehydrogenase  33.8 
 
 
434 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0618  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  33.8 
 
 
434 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.04 
 
 
434 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 
434 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.8 
 
 
457 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  33.43 
 
 
433 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
438 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.78 
 
 
424 aa  191  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  32.68 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
434 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0276  nucleotide sugar dehydrogenase  32.22 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  32.68 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  33.15 
 
 
434 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.74 
 
 
471 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  31.04 
 
 
459 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.32 
 
 
436 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  32.76 
 
 
440 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  32.96 
 
 
427 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2354  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.61 
 
 
453 aa  186  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.241791  hitchhiker  0.0025213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1513  nucleotide sugar dehydrogenase  31.11 
 
 
437 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  31.41 
 
 
449 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  31.41 
 
 
449 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  30.49 
 
 
522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  32.04 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  32.25 
 
 
445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.15 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1145  nucleotide sugar dehydrogenase  31.17 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.05 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0952  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.1 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.134556  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  30.03 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  32.33 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  32.33 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  32.25 
 
 
441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  29.72 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3266  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.24 
 
 
453 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  31.96 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  31.91 
 
 
451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1388  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.32 
 
 
442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  31.96 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  30.52 
 
 
448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1581  nucleotide sugar dehydrogenase  30.58 
 
 
434 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000172348  hitchhiker  5.43312e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4994  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.25 
 
 
456 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3497  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.51 
 
 
472 aa  182  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183251  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  32.2 
 
 
445 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  31.42 
 
 
470 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.7 
 
 
447 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  31.49 
 
 
463 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.83 
 
 
436 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  31.15 
 
 
470 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  32.08 
 
 
447 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  31.77 
 
 
440 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.15 
 
 
470 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  32 
 
 
441 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  31.61 
 
 
443 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  31.77 
 
 
456 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  32.25 
 
 
442 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  30.83 
 
 
457 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.65 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.76 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  30.83 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  30.87 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>