More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1896 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1896  GDP-mannose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  949    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883945  normal  0.0307058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1678  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.02 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165535  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.92 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18580  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  44.55 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.156779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4561  GDP-mannose 6-dehydrogenase  42.38 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1605  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  44.31 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.952196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5882  nucleotide sugar dehydrogenase  42.79 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.969972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1063  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.56 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.763895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1288  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.93 
 
 		 438 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4437  GDP-mannose 6-dehydrogenase  41.93 
 
 		 438 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.379553  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1243  GDP-mannose 6-dehydrogenase AlgD  43.09 
 
 		 438 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1031  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.61 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0889  nucleotide sugar dehydrogenase  41.7 
 
 		 438 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10970  GDP-mannose 6-dehydrogenase  45.66 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0655  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.13 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0673  GDP-mannose 6-dehydrogenase  43.32 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0577586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3792  GDP-mannose 6-dehydrogenase  39.85 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2940  nucleotide sugar dehydrogenase  39.08 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3220  GDP-mannose 6-dehydrogenase  37.23 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.712763  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3885  nucleotide sugar dehydrogenase  39.12 
 
 		 420 aa  264  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1796  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.73 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.101485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1699  GDP-mannose 6-dehydrogenase  40.11 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1719  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.08 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1505  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.39 
 
 		 424 aa  251  3e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000902471  normal  0.721727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2781  nucleotide sugar dehydrogenase  39.17 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.16 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1764  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.796911  normal  0.409605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3078  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.64 
 
 		 426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.455066  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.33 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1430  nucleotide sugar dehydrogenase  34.87 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2263  GDP-mannose 6-dehydrogenase  33.91 
 
 		 451 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.65 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  35.13 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  36.57 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.77 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  33.84 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.84 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  33.71 
 
 		 473 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.22 
 
 		 428 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.71 
 
 		 473 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.48 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.08 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.41 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  33.78 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.19 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  33.19 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.19 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  33.26 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.37 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  33.55 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0917  nucleotide sugar dehydrogenase  34.82 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.834794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 		 473 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.32 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.01 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.95 
 
 		 438 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  36.99 
 
 		 454 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  31.67 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.08 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  35.91 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3290  nucleotide sugar dehydrogenase  32.22 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  32.49 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  33.94 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  35.31 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.19 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  33.85 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  35.6 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  36.99 
 
 		 454 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  32.96 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.28 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  32.33 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  31.05 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  35.38 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  34.07 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.89 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.78 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  37.95 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  34.52 
 
 		 440 aa  220  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  35.05 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  37.95 
 
 		 438 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  32.65 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  38.78 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.46 
 
 		 467 aa  220  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.89 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.89 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.33 
 
 		 467 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.29 
 
 		 433 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  32.46 
 
 		 440 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  38.78 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.05 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 		 440 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.75 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.48 
 
 		 442 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.65 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.97 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>