73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3489 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3489  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 224 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  95.98 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  54.95 
 
 		 226 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  54.05 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  56.05 
 
 		 226 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0551  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0546  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3793  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3786  cyclic nucleotide-binding protein  43.24 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1840  cyclic nucleotide-binding protein  41.89 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00716362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2717  cyclic nucleotide binding protein, putative  42.34 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3273  cyclic nucleotide binding protein, putative  41.89 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  normal  0.0894571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  40.54 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3424  cyclic nucleotide-binding protein  40.89 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1659  cyclic nucleotide-binding protein  41.44 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  38.22 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  36.92 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.32 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  23.83 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.88 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2394  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.11 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 408 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  25.56 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000366193  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  26 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.39 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.95 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  25.67 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  23.01 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4116  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  22.7 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.46 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  30.53 
 
 		 419 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.08 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.98 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.39 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 		 608 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  25.41 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  27.37 
 
 		 412 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  22.99 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.24 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  25.54 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.39 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  26.32 
 
 		 621 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.44 
 
 		 228 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 		 225 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.25 
 
 		 254 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.46 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  23.66 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.46 
 
 		 225 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>