50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2717 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2717  cyclic nucleotide binding protein, putative  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1659  cyclic nucleotide-binding protein  96.9 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1840  cyclic nucleotide-binding protein  92.04 
 
 		 226 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00716362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  92.48 
 
 		 226 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3273  cyclic nucleotide binding protein, putative  66.37 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  normal  0.0894571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3786  cyclic nucleotide-binding protein  65.02 
 
 		 223 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3424  cyclic nucleotide-binding protein  62.5 
 
 		 226 aa  304  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  46.4 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  44.2 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  42.41 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  43.24 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3489  cyclic nucleotide-binding protein  42.34 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3793  cyclic nucleotide-binding protein  42.17 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0551  cyclic nucleotide-binding protein  42.17 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0546  cyclic nucleotide-binding protein  41.74 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  33.16 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  32.46 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  25.94 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00758  putative transcriptional regulator (Crp family) protein  24.75 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.29 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0091  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  23 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.12 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  28.97 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.5 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.49 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  25.84 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 230 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.89 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>