58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3793 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3793  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0546  cyclic nucleotide-binding protein  99.13 
 
 		 230 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0551  cyclic nucleotide-binding protein  99.57 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  53.36 
 
 		 226 aa  261  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  52.47 
 
 		 226 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  54.5 
 
 		 226 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  48.66 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3489  cyclic nucleotide-binding protein  47.77 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3786  cyclic nucleotide-binding protein  43.95 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  42.17 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2717  cyclic nucleotide binding protein, putative  42.17 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1659  cyclic nucleotide-binding protein  42.61 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131527  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1840  cyclic nucleotide-binding protein  41.74 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00716362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3273  cyclic nucleotide binding protein, putative  41.7 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  normal  0.0894571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3424  cyclic nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  31.22 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  31.16 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.41 
 
 		 624 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  25.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  25.56 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.3 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  26.32 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1117  patatin  31.63 
 
 		 621 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  26.55 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  23.19 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.64 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4909  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0091  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.89 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.38 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  23.87 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.04 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  26.55 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  32.65 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  28.16 
 
 		 731 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.76 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  26.55 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.97 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  19.68 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.83 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.92 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  23.12 
 
 		 228 aa  42  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28 
 
 		 212 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  23.68 
 
 		 265 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2394  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 255 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0405792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.62 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>