47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000333 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000333  predicted N-ribosylNicotinamide CRP-like regulator  100 
 
 		 226 aa  474  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000153311  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06137  hypothetical protein  85.4 
 
 		 226 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  57.96 
 
 		 226 aa  284  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0546  cyclic nucleotide-binding protein  54.26 
 
 		 230 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0551  cyclic nucleotide-binding protein  53.81 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3793  cyclic nucleotide-binding protein  53.36 
 
 		 230 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4298  cyclic nucleotide binding protein, putative  54.95 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3489  cyclic nucleotide-binding protein  54.95 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3786  cyclic nucleotide-binding protein  46.19 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1840  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00716362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3273  cyclic nucleotide binding protein, putative  44.39 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  normal  0.0894571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2717  cyclic nucleotide binding protein, putative  44.2 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  43.3 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1659  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3424  cyclic nucleotide-binding protein  44.64 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1924  cyclic nucleotide binding protein, putative  38.78 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3683  cyclic nucleotide binding protein, putative  34.15 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.89 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0091  hypothetical protein  23.5 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.83 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.31 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  21.43 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.38 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.38 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.45 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.85 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.38 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  30.97 
 
 		 749 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  26.34 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  24 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 223 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.87 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.27 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>