More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2656 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  93.66 
 
 		 363 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  92.56 
 
 		 363 aa  678    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  92.29 
 
 		 363 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  92.84 
 
 		 363 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  94.49 
 
 		 363 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  94.49 
 
 		 378 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  95.04 
 
 		 363 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  92.56 
 
 		 363 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  77.27 
 
 		 356 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  76.77 
 
 		 360 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  73.76 
 
 		 362 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  72.38 
 
 		 377 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  73.43 
 
 		 356 aa  521  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  62.75 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  46.8 
 
 		 377 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  45.58 
 
 		 353 aa  315  6e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  46.22 
 
 		 377 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  46.7 
 
 		 352 aa  311  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.65 
 
 		 424 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.18 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  43.48 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  47.26 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  43.15 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  41.31 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  40.7 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.59 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  38.84 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.04 
 
 		 358 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.86 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  38.15 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  39.47 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  37.28 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  38.95 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  32.82 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  35.03 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 345 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.23 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  28.27 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.85 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  26.85 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.43 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.34 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.22 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.18 
 
 		 464 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.44 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.79 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.23 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.94 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.43 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.29 
 
 		 426 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 		 464 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.08 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.62 
 
 		 425 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.76 
 
 		 421 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  28.65 
 
 		 464 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.92 
 
 		 433 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  31.61 
 
 		 438 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  31.41 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  26.65 
 
 		 429 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.85 
 
 		 448 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.08 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.66 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.03 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.79 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  28.03 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  26.29 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  28.53 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  27.12 
 
 		 442 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  26.15 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.1 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  27.25 
 
 		 439 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.63 
 
 		 434 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  27.84 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  22.19 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  29.96 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  27.79 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  26.53 
 
 		 442 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  26.63 
 
 		 444 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  24.72 
 
 		 435 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  28.62 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  26.77 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  28.38 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  29.97 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  28.22 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  27.01 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.25 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  27.01 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  28.38 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  27.03 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  25.25 
 
 		 424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  31.22 
 
 		 346 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0565  hemolysin-like protein  31.52 
 
 		 459 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000485397  hitchhiker  0.00159471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>