More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03564 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  735    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  63.99 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  47.29 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  40.06 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  39.77 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  45.35 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  44.02 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  43.86 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  43.99 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  44.44 
 
 		 377 aa  268  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  38.42 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  42.02 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  42.46 
 
 		 360 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  41.92 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  42.11 
 
 		 362 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  40.92 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  40.5 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  40.5 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  40.5 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  42.4 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  40.22 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  40.22 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  39.94 
 
 		 363 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  39.67 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  39.39 
 
 		 363 aa  255  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  39.64 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  38.84 
 
 		 363 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  40.94 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  39.07 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  39.04 
 
 		 342 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  36.13 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  40.17 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  36.89 
 
 		 358 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  38.86 
 
 		 344 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.83 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  38.35 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  34.76 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  32.95 
 
 		 347 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  32.25 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  30.06 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.75 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  29.67 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.65 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  30.86 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.75 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  30.98 
 
 		 440 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.28 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  32.97 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  26.43 
 
 		 412 aa  115  8.999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.62 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  29.29 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.49 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.27 
 
 		 414 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  26.01 
 
 		 449 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.18 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  28.53 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  29.45 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.52 
 
 		 448 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.73 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  29.24 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  29.24 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  27.73 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.82 
 
 		 443 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.57 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  24.78 
 
 		 434 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  25.08 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  30.99 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  26.65 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.43 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.57 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3491  protein of unknown function DUF21  28.29 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532364  normal  0.141748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2612  protein of unknown function DUF21  28.29 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  25.23 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  29.92 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  28.91 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  28.91 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  27.35 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  26.27 
 
 		 426 aa  102  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.09 
 
 		 424 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  26.89 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  25.69 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  30.49 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  27.76 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  29.51 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  24.44 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  28.19 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  26.11 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  25.85 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  28.2 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  25.29 
 
 		 436 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.81 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  27.38 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  25.49 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  26.73 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  25.49 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.63 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>