More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3009 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  99.72 
 
 
363 aa  741    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  92.84 
 
 
363 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  92.84 
 
 
363 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  99.45 
 
 
363 aa  740    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  742    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  94.21 
 
 
363 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  94.21 
 
 
378 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  99.72 
 
 
363 aa  741    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  94.49 
 
 
363 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  79.26 
 
 
356 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  77.05 
 
 
360 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  75.64 
 
 
362 aa  546  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  74.31 
 
 
377 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  74.57 
 
 
356 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  63.04 
 
 
360 aa  474  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  47.38 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  46.8 
 
 
377 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  47.43 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  45.58 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  44.51 
 
 
365 aa  298  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  42.54 
 
 
424 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  42.05 
 
 
473 aa  288  7e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  46.65 
 
 
376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  40.87 
 
 
340 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  43.02 
 
 
394 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  40.17 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.47 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  40.22 
 
 
360 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  37.6 
 
 
363 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  38.35 
 
 
349 aa  235  7e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  36.42 
 
 
358 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.28 
 
 
358 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  36.81 
 
 
347 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.24 
 
 
349 aa  196  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  33.44 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  34.49 
 
 
345 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  35.14 
 
 
345 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  30.35 
 
 
353 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.21 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  29.79 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.45 
 
 
424 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.45 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.34 
 
 
422 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.11 
 
 
424 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.22 
 
 
420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.82 
 
 
421 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.65 
 
 
417 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.63 
 
 
429 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.32 
 
 
464 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.81 
 
 
421 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.48 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.53 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.22 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  29.9 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  28.95 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.33 
 
 
433 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  26.43 
 
 
429 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  28.71 
 
 
442 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.86 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.29 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.95 
 
 
448 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.29 
 
 
426 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.39 
 
 
447 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  28 
 
 
428 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
417 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  27.59 
 
 
437 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  28.06 
 
 
442 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.96 
 
 
426 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.37 
 
 
442 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.37 
 
 
442 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.47 
 
 
447 aa  124  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
427 aa  122  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.1 
 
 
422 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  27.17 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  28.02 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  28.16 
 
 
432 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  26.1 
 
 
470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  30.6 
 
 
436 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  26.57 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  29.14 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.49 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  27.25 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  30.17 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0778  hypothetical protein  30.17 
 
 
420 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326881  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.07 
 
 
435 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  30.38 
 
 
445 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 
432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  29.89 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.83 
 
 
468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  25.08 
 
 
424 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  27.62 
 
 
444 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0826  CBS domain-containing protein  27.73 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  26.87 
 
 
433 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  25.15 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  25.37 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  25.75 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>