More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2649 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  718    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  78.74 
 
 		 377 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  78.45 
 
 		 377 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  67.05 
 
 		 353 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  48.14 
 
 		 363 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  48.14 
 
 		 378 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  47.85 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  47.56 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  47.43 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  47.14 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  47.14 
 
 		 363 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  47.43 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  46.7 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  47.86 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  46.75 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  47.85 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  47.77 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  46.86 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  43.15 
 
 		 360 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  48.04 
 
 		 376 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.47 
 
 		 424 aa  285  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  44.38 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  42.56 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  45.21 
 
 		 394 aa  275  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  42.98 
 
 		 473 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  40.91 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  44.06 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  43.99 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  41.13 
 
 		 358 aa  269  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  39.44 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  40.51 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.42 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  38.05 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  39.18 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  38.32 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  36.13 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  33.23 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  34.29 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  30.06 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.88 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.69 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.15 
 
 		 425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  28.81 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  27.54 
 
 		 431 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.28 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  29.51 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  25.51 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  26.73 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  25.15 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 		 464 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  24.85 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  25.22 
 
 		 424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.24 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  24.71 
 
 		 422 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  28 
 
 		 477 aa  116  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  27.42 
 
 		 420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  27.1 
 
 		 442 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  27.1 
 
 		 442 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.79 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.4 
 
 		 429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  24.67 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  27.1 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  28.85 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  27.64 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.42 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  28.9 
 
 		 446 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  31.56 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  28.48 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.05 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  29.38 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  28.7 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.58 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  26.39 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  27.66 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  26.77 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  27.88 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.72 
 
 		 447 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  27.05 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  28.66 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  28.7 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  27.06 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  25.87 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  25.4 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  27.42 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15621  hypothetical protein  26.1 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  27.05 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  26.33 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  24.68 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  26.32 
 
 		 423 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  30.03 
 
 		 426 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  27.78 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  28.01 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  26.67 
 
 		 440 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  27.16 
 
 		 421 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  26.89 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>