More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0859 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  792    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  60.47 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  50.88 
 
 		 473 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  53.24 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  49.85 
 
 		 357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  49.42 
 
 		 376 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  281  9e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  41.62 
 
 		 358 aa  280  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  43.73 
 
 		 362 aa  279  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  43.66 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  42.86 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  46.41 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  42.86 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  43.15 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  42.86 
 
 		 363 aa  276  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  43.73 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  43.31 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  43.02 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  43.02 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  46.11 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  42.73 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  43.19 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  42.86 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  41.98 
 
 		 363 aa  269  8e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  45.21 
 
 		 352 aa  269  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  41.49 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  43.73 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  41.24 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.16 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  41.69 
 
 		 377 aa  259  8e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  43.49 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  42.02 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  41.45 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  42.73 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  36.96 
 
 		 342 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  36.23 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  35.62 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  35 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  35.17 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  29.13 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.38 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.62 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  31.92 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  29.64 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.6 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.49 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  30.64 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.45 
 
 		 430 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.96 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  30.03 
 
 		 439 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.52 
 
 		 439 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  31.29 
 
 		 418 aa  129  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  30.97 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.78 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.49 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.53 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  29.34 
 
 		 429 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.19 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  30.46 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  30.83 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  30.83 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.98 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.45 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.89 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  28.83 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  33.61 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  29.9 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  26.52 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.18 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.53 
 
 		 425 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15621  hypothetical protein  27.96 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  27.71 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  27.38 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.82 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  31.67 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  31.41 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.77 
 
 		 455 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.99 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  28.96 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.65 
 
 		 429 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  30.08 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  24.76 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  28.27 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  29.96 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  26.28 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  24.76 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  33.21 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  27.74 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  24.76 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.21 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  27.91 
 
 		 452 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  25.81 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  25.81 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>