More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1286 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  81.67 
 
 		 362 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  80.78 
 
 		 360 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  77.75 
 
 		 356 aa  554  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  74.31 
 
 		 363 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  74.03 
 
 		 363 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  74.03 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  74.03 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  74.93 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  74.65 
 
 		 363 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  74.65 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  73.54 
 
 		 363 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  72.38 
 
 		 363 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  75.29 
 
 		 356 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  65.9 
 
 		 360 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  48.41 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  47.83 
 
 		 377 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  47.86 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  45.51 
 
 		 353 aa  302  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  44.38 
 
 		 424 aa  301  9e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  44.28 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.93 
 
 		 473 aa  292  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  44.06 
 
 		 340 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  46.83 
 
 		 376 aa  279  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  40.83 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.81 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  44.44 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  41.69 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  41.3 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  39.07 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.24 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.91 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  37.75 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  40.29 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  36.28 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  35.22 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  36.61 
 
 		 345 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  32.46 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  30.91 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.97 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.11 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.72 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.8 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.56 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.09 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.85 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.43 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.79 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 		 426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.95 
 
 		 464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  27.51 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.24 
 
 		 422 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.36 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  28.7 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  28.78 
 
 		 442 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  30.23 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.13 
 
 		 420 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  30.23 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  28.92 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.32 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.8 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  30.36 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  28.15 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  27.24 
 
 		 417 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  27.59 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.7 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.4 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  28.88 
 
 		 487 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  29.75 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  26.59 
 
 		 432 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.18 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.63 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.44 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  28.79 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  30.17 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.23 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  23.6 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  29.41 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  28.85 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  28.85 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  28.85 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.25 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  28.9 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  28.91 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.89 
 
 		 435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.52 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  26.76 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.63 
 
 		 451 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  28.69 
 
 		 444 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  27.71 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  27.78 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  30.04 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3491  protein of unknown function DUF21  28.34 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532364  normal  0.141748 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.14 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>