More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0830 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
376 aa  740    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  50.73 
 
 
365 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  51.57 
 
 
357 aa  352  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  49.03 
 
 
424 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  49.42 
 
 
394 aa  325  6e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  50.89 
 
 
473 aa  325  9e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  46.2 
 
 
363 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  46.83 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  44.51 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  46.56 
 
 
363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  46.56 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  48.55 
 
 
377 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  45.94 
 
 
363 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  49.11 
 
 
349 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  45.45 
 
 
363 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  45.45 
 
 
363 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  48.7 
 
 
377 aa  299  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  45.18 
 
 
363 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  45.18 
 
 
363 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  45.3 
 
 
377 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  45.73 
 
 
363 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  43.19 
 
 
358 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  46.89 
 
 
356 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  46.76 
 
 
360 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  47.25 
 
 
352 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  44.22 
 
 
360 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  41.26 
 
 
358 aa  291  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  47.04 
 
 
360 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  42.61 
 
 
353 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  45.03 
 
 
340 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  44.93 
 
 
356 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  44.15 
 
 
342 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  42.52 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  45.35 
 
 
349 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  40 
 
 
345 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  38.27 
 
 
344 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
353 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  37.87 
 
 
345 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  34.04 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  36.6 
 
 
347 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.89 
 
 
417 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  34.67 
 
 
421 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.44 
 
 
421 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.28 
 
 
420 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 
417 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  35.4 
 
 
420 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.45 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.27 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.57 
 
 
422 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.95 
 
 
448 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  29.66 
 
 
431 aa  137  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.07 
 
 
420 aa  137  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  32.34 
 
 
464 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  32.08 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.44 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  25.87 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.31 
 
 
421 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  27.88 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  31.62 
 
 
414 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.45 
 
 
445 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.44 
 
 
426 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.74 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  33.88 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  31.45 
 
 
445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.82 
 
 
429 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  31.29 
 
 
429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  34.52 
 
 
455 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 
424 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.91 
 
 
429 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.16 
 
 
433 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  34.13 
 
 
455 aa  123  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  31.93 
 
 
444 aa  122  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  27.95 
 
 
422 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  34.18 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  34.18 
 
 
449 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.25 
 
 
432 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  28.14 
 
 
432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  34.17 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30 
 
 
451 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  30.72 
 
 
442 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30 
 
 
443 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  30.72 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.31 
 
 
434 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  29.57 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  33.82 
 
 
439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.82 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.91 
 
 
442 aa  117  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.18 
 
 
443 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  31.05 
 
 
487 aa  117  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  28.97 
 
 
421 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  30.45 
 
 
443 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>