More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002181 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  100 
 
 		 377 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  93.9 
 
 		 377 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  78.41 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  69.32 
 
 		 353 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  48.44 
 
 		 363 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  48.44 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  48.44 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  47.88 
 
 		 363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  47.31 
 
 		 363 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  47.03 
 
 		 363 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  46.65 
 
 		 362 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  47.31 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  47.03 
 
 		 363 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  47.19 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  46.74 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  44.57 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  45.77 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  47.21 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  47.29 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  49.7 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  46.13 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.29 
 
 		 424 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.96 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  46.11 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.1 
 
 		 473 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  41.48 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  44.77 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  44.02 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  42.46 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  39.65 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.9 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  40.54 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  41.72 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  37.69 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  38.81 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  36.31 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  37.2 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  32.4 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  30.21 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  32.57 
 
 		 347 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.64 
 
 		 417 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.08 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.62 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  28.8 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  30.4 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  27.36 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  29.61 
 
 		 418 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  25.22 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  28.33 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  27.87 
 
 		 423 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  27.46 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  27 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  27.73 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  29.72 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  28.35 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  24.93 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.39 
 
 		 424 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.79 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.72 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  26.38 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.67 
 
 		 429 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  26.3 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  32.6 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.04 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  29.64 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  27.68 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  25.07 
 
 		 422 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  26.3 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  29.41 
 
 		 427 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  28 
 
 		 427 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  26.71 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  29.94 
 
 		 426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  27.49 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  26.88 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  26.9 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  29.23 
 
 		 426 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  25.9 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  28.88 
 
 		 439 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  29.77 
 
 		 428 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  25.42 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  33.2 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  29.62 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  25.32 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.02 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  26.36 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  27.43 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  28.43 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  27.11 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27.49 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  27.08 
 
 		 479 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  27.36 
 
 		 421 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  27.47 
 
 		 439 aa  109  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  27 
 
 		 429 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>