More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0187 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  54.1 
 
 
342 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  52.31 
 
 
353 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15621  hypothetical protein  42.14 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0499  hypothetical protein  44.66 
 
 
331 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.279814  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04931  hypothetical protein  43.69 
 
 
331 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2177  hypothetical protein  44.66 
 
 
332 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.384198 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16451  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.9195  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18421  hypothetical protein  42.81 
 
 
330 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.465045 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0974  SBC domain-containing protein  42.81 
 
 
330 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16331  hypothetical protein  39.67 
 
 
325 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1536  hypothetical protein  39.02 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.456191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16221  hypothetical protein  38.89 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.698801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  38.32 
 
 
344 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  37.57 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  32.31 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  36.42 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  38.28 
 
 
418 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  32.28 
 
 
353 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  36.34 
 
 
349 aa  185  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  38.15 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 
417 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.69 
 
 
425 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  36.42 
 
 
357 aa  179  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  36.83 
 
 
473 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  34.29 
 
 
352 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  34.52 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  32.95 
 
 
360 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  35.17 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  31.02 
 
 
358 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.64 
 
 
421 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.69 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  33.64 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  36.2 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.23 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  34.18 
 
 
426 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  32.57 
 
 
377 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.54 
 
 
429 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.54 
 
 
425 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  31.29 
 
 
448 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.99 
 
 
414 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  28.93 
 
 
358 aa  160  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  31.3 
 
 
356 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  31.71 
 
 
377 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  31.05 
 
 
360 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  34.62 
 
 
420 aa  155  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  34.12 
 
 
443 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  32.66 
 
 
360 aa  155  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  31.01 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.17 
 
 
443 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  30.72 
 
 
363 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  30.72 
 
 
378 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 
422 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  31.75 
 
 
340 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.11 
 
 
429 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  30.92 
 
 
363 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  31.9 
 
 
456 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  33.54 
 
 
342 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  30.2 
 
 
362 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  31.21 
 
 
363 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.45 
 
 
424 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  29.86 
 
 
356 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  30.92 
 
 
363 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  32.46 
 
 
377 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  33.14 
 
 
428 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  31.74 
 
 
349 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  31.21 
 
 
363 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  31.79 
 
 
363 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  34.08 
 
 
464 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  31.23 
 
 
363 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  33.05 
 
 
464 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.66 
 
 
467 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.65 
 
 
424 aa  149  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  30.72 
 
 
424 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.72 
 
 
468 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  32.72 
 
 
417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  32.73 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  31.61 
 
 
429 aa  148  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  33.13 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  34.14 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  33.14 
 
 
464 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  29.17 
 
 
498 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  30.75 
 
 
447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.73 
 
 
424 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.71 
 
 
435 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  31.63 
 
 
440 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 
443 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.77 
 
 
421 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 
432 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.77 
 
 
421 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2612  protein of unknown function DUF21  31.72 
 
 
379 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  31.63 
 
 
447 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  35.29 
 
 
420 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  33.23 
 
 
477 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3491  protein of unknown function DUF21  31.72 
 
 
379 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.532364  normal  0.141748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.43 
 
 
441 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  29.66 
 
 
430 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  31.61 
 
 
422 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  36.05 
 
 
427 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>