More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2369 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  728    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  74.57 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  74.86 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  74.86 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  74.29 
 
 		 363 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  74.29 
 
 		 363 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  74.86 
 
 		 378 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  74.29 
 
 		 363 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  72.6 
 
 		 362 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  75.29 
 
 		 377 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  73.71 
 
 		 363 aa  524  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  73.71 
 
 		 356 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  72.47 
 
 		 360 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  73.43 
 
 		 363 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  62.18 
 
 		 360 aa  464  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  47.97 
 
 		 377 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  46.48 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  47.23 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  46.7 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  47.38 
 
 		 377 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  46.86 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  47.08 
 
 		 473 aa  299  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  45.01 
 
 		 357 aa  289  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  44.19 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  43.73 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  43.86 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  41.59 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  44.71 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  41.14 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.82 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  37.99 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.94 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  36.02 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  38.84 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  36.11 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  36.63 
 
 		 345 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  34.63 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  30.7 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.3 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  29.19 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.97 
 
 		 422 aa  142  8e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.86 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.55 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.45 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.39 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.14 
 
 		 425 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  33.2 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  25.9 
 
 		 424 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.22 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  25.81 
 
 		 447 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 		 426 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  29.87 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.74 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.53 
 
 		 430 aa  119  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.91 
 
 		 422 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.22 
 
 		 426 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  28.48 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  27.14 
 
 		 433 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.86 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  26.63 
 
 		 435 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  30.42 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  26.49 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  27.22 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.44 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  30.14 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.14 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  29.39 
 
 		 447 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18421  hypothetical protein  24.76 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.465045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  26.18 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  30.4 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0974  SBC domain-containing protein  24.76 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  25.48 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  30.04 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.5 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  28.75 
 
 		 444 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.03 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.17 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  27.38 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.62 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  31.08 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  26.79 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  28.93 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  27.16 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  28.01 
 
 		 448 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 		 444 aa  109  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  27.84 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  29.06 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  29.29 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 435 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  26.19 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  28.15 
 
 		 435 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.29 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  25.86 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  25.07 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0252  hemolysin-like protein  26.67 
 
 		 466 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>