More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1845 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  726    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  80.39 
 
 		 358 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  45.92 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  41.91 
 
 		 357 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  44.11 
 
 		 376 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  41.49 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  40.48 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  41.09 
 
 		 424 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  39.66 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  39.44 
 
 		 352 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  39.88 
 
 		 473 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  39.08 
 
 		 340 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  39.53 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  40.34 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  40.29 
 
 		 362 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  37.9 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  37.18 
 
 		 377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  37.86 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  38.9 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  34.87 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  37.57 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  37.28 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  37.28 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  38.73 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  37.28 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  38.08 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  37.28 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  36.99 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  36.99 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  37.28 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.43 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  37.94 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  37.91 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  38.37 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  36.89 
 
 		 360 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  36.84 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  36.06 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  33.23 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.02 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  30.22 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.32 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.56 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  34.4 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  26.64 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  31.98 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  31.98 
 
 		 346 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.66 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  26.12 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 341 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  29.24 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  24.62 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  27.64 
 
 		 457 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  27.64 
 
 		 457 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  28.11 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.52 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  27.95 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  27.95 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  26.01 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  26.05 
 
 		 442 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  28.48 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  26.43 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  27.86 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.79 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  29.25 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  26.93 
 
 		 421 aa  115  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  26.75 
 
 		 434 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  29.2 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1682  protein of unknown function DUF21  28.87 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000471578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  28.82 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  26.22 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  27.02 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  29.78 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  24.7 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  28.47 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  23.82 
 
 		 435 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  24.58 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  25.42 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.66 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  27.34 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  24.74 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  24.85 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  26.13 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  27.59 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.18 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  24.74 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  24.74 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  29.6 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  24.74 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  24.74 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  24.74 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  24.74 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  27.05 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  24.74 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  28.37 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  27.84 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  27.84 
 
 		 445 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>