More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1941 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  689    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  74.48 
 
 
345 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  66.96 
 
 
345 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  55.65 
 
 
349 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  37.31 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.35 
 
 
358 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  38.1 
 
 
347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  36.98 
 
 
377 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  38.68 
 
 
360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  35.8 
 
 
377 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  36.76 
 
 
365 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  35.09 
 
 
357 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  33.43 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
353 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  34.86 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  33.92 
 
 
424 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  35.63 
 
 
394 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  37.2 
 
 
376 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  36.31 
 
 
349 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  32.17 
 
 
360 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  35.91 
 
 
342 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  35.21 
 
 
362 aa  185  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  35.78 
 
 
356 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  33.03 
 
 
473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  36.84 
 
 
340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  32.16 
 
 
363 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
347 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  33.93 
 
 
356 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  35.93 
 
 
377 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  33.83 
 
 
363 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  33.53 
 
 
363 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  33.83 
 
 
363 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  33.53 
 
 
363 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  34.59 
 
 
360 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  34.12 
 
 
363 aa  175  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  33.53 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  34.12 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  34.12 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  33.24 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.84 
 
 
414 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.2 
 
 
417 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 
421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  29.03 
 
 
417 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.04 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.48 
 
 
422 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  30.16 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.21 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  28 
 
 
467 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  35.83 
 
 
435 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  34.55 
 
 
439 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.19 
 
 
448 aa  129  9.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  28.31 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  28.31 
 
 
449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  27.74 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  30.98 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  33.47 
 
 
444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  27.85 
 
 
422 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  34.6 
 
 
440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  26.81 
 
 
470 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  34.73 
 
 
442 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  34.73 
 
 
442 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  34.31 
 
 
442 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.62 
 
 
434 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
442 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
442 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  34.31 
 
 
442 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  34.73 
 
 
442 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  34.73 
 
 
442 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
435 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.16 
 
 
424 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  26.71 
 
 
477 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  33.88 
 
 
440 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.13 
 
 
424 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  33.85 
 
 
436 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  33.85 
 
 
436 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  33.85 
 
 
436 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  30.71 
 
 
429 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  29.97 
 
 
490 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  36.04 
 
 
432 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  26.81 
 
 
424 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  29.34 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  28.14 
 
 
442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  30.86 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 
464 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  26.84 
 
 
449 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  30.03 
 
 
440 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0499  hypothetical protein  30.48 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.279814  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  27.49 
 
 
433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  28.48 
 
 
438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  30.75 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  34.57 
 
 
432 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.02 
 
 
464 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 
483 aa  119  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  33.48 
 
 
434 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  30.46 
 
 
447 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  34.38 
 
 
537 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  27.38 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>