More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1428 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  87.47 
 
 		 362 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  80.78 
 
 		 377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  80.68 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  76.77 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  76.77 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  77.05 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  76.97 
 
 		 363 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  77.05 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  77.25 
 
 		 363 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  76.97 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  76.77 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  76.12 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  72.47 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  65.33 
 
 		 360 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  47.38 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  46.8 
 
 		 377 aa  309  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  44.75 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  45.87 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  46.46 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  44.96 
 
 		 473 aa  298  9e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  43.7 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  42.61 
 
 		 340 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  42.45 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  48.78 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  43.73 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  42.46 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.41 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  41 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  38.61 
 
 		 363 aa  238  8e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  38.73 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.62 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  38.44 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  39.71 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  34.86 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  35.52 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  35.26 
 
 		 345 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  31.41 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  32.66 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  30.91 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  30.84 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.33 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.22 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.94 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.51 
 
 		 424 aa  133  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.42 
 
 		 421 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.72 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  29.46 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  26.33 
 
 		 424 aa  126  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.79 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.84 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  31.82 
 
 		 431 aa  123  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.33 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  29.94 
 
 		 448 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.53 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.9 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  29.75 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.34 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.1 
 
 		 422 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.21 
 
 		 429 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.56 
 
 		 430 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  27.91 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.78 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  27.63 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.84 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  28.32 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.16 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.63 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  27.27 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  27.27 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  25.15 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  26.73 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  30.77 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  25.15 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  27.05 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.32 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  27.08 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  27.61 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  27.84 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  28.69 
 
 		 447 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27 
 
 		 429 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  27.02 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  27.58 
 
 		 439 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2329  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 		 470 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  27.02 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  28 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  27.88 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  29.79 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  24.76 
 
 		 432 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  29.19 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  25.63 
 
 		 451 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  28.02 
 
 		 443 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  25.23 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  28.28 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  26.82 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  26.29 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>