More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03595 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  733    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  47.32 
 
 
376 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  43.79 
 
 
365 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.87 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  43.02 
 
 
357 aa  280  4e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  43.15 
 
 
473 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  42.21 
 
 
377 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  42.78 
 
 
377 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  41.16 
 
 
358 aa  262  8e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  39.66 
 
 
358 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  40.51 
 
 
352 aa  255  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  40.23 
 
 
362 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.63 
 
 
342 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  37.82 
 
 
353 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  39.51 
 
 
363 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  39.24 
 
 
363 aa  242  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  39.07 
 
 
360 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  39.22 
 
 
356 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  39.24 
 
 
363 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  39.24 
 
 
378 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  37.57 
 
 
360 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  39.07 
 
 
377 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  38.61 
 
 
360 aa  235  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  38.15 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  37.99 
 
 
356 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  37.6 
 
 
363 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  37.6 
 
 
363 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  37.6 
 
 
363 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  40.63 
 
 
340 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  37.6 
 
 
363 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  39.18 
 
 
349 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  39.94 
 
 
347 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  35.86 
 
 
349 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  32.62 
 
 
344 aa  186  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  32.94 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 
353 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 
345 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  30.64 
 
 
347 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  31.71 
 
 
342 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.83 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
341 aa  126  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.89 
 
 
422 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  29.04 
 
 
461 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.58 
 
 
448 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.78 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.66 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  32.61 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.44 
 
 
429 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  28.31 
 
 
464 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  30.36 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  31.23 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
417 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.71 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.67 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  27 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0450  hypothetical protein  27.33 
 
 
418 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00320716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  28.18 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.92 
 
 
428 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.42 
 
 
421 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.42 
 
 
421 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  31.85 
 
 
447 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.38 
 
 
430 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  26.29 
 
 
432 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  28.78 
 
 
433 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  28.49 
 
 
439 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
464 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  25.54 
 
 
447 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  24.32 
 
 
429 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  25.77 
 
 
424 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.16 
 
 
424 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0555  protein of unknown function DUF21  27.49 
 
 
443 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.68 
 
 
443 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.35 
 
 
417 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  25.07 
 
 
420 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  25.46 
 
 
424 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.32 
 
 
429 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 
425 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  26.3 
 
 
425 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  30.49 
 
 
444 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  26.61 
 
 
446 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  27.82 
 
 
426 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.64 
 
 
442 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.94 
 
 
455 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  25.91 
 
 
464 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.53 
 
 
455 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  27.46 
 
 
426 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27.59 
 
 
429 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  27.63 
 
 
420 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  25.47 
 
 
437 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  30.92 
 
 
428 aa  99.8  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  27.92 
 
 
453 aa  99.8  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  26.09 
 
 
442 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 
444 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  25.76 
 
 
410 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  31.56 
 
 
428 aa  99.4  8e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  25.91 
 
 
442 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>