More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3316 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  93.66 
 
 		 363 aa  680    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  739    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  92.29 
 
 		 363 aa  675    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  92.84 
 
 		 363 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  92.56 
 
 		 363 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  97.25 
 
 		 363 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  97.25 
 
 		 378 aa  699    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  97.25 
 
 		 363 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  92.56 
 
 		 363 aa  675    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  77.84 
 
 		 356 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  74.59 
 
 		 362 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  76.12 
 
 		 360 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  73.54 
 
 		 377 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  73.71 
 
 		 356 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  63.04 
 
 		 360 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  47.97 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  47.38 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  45.3 
 
 		 353 aa  315  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  47.56 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  43.09 
 
 		 424 aa  298  9e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  42.61 
 
 		 473 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  43.19 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  46.95 
 
 		 376 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  40.7 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  41.03 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  41.98 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  39.39 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  40.29 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  39.24 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  37.46 
 
 		 358 aa  235  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  37.28 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  38.28 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  36.23 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  38.55 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  33.13 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  34.38 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  34.86 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  30.64 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  31.79 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  29.18 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.4 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.12 
 
 		 424 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.48 
 
 		 424 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.08 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.38 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.8 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.49 
 
 		 464 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  29.79 
 
 		 421 aa  135  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.97 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  28.37 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.79 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.57 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.57 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  29.08 
 
 		 464 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  26.36 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  26.11 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  26.65 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.84 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  32.31 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.33 
 
 		 433 aa  123  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  28.92 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  26.57 
 
 		 451 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 		 426 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 451 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  26.57 
 
 		 451 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 451 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.61 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  26.35 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.25 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  26.57 
 
 		 428 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  26.69 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  29.38 
 
 		 424 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  31.99 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  28.32 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  28.2 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  27.42 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  26.05 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0252  hemolysin-like protein  28.96 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  26.05 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  30.96 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0918  hypothetical protein  33.2 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0936  hypothetical protein  33.2 
 
 		 346 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 		 447 aa  116  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  28.92 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  26.05 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  27.65 
 
 		 418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  27.17 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  28.39 
 
 		 428 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  23.91 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  25.3 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  27.65 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  25.97 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  27.12 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.6 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>