More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3134 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 345 aa  694    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  74.48 
 
 		 344 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1479  CBS  65.7 
 
 		 345 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  56.81 
 
 		 349 aa  374  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  38.71 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  36.84 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  37.57 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  36.83 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  38.3 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  36.97 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  37.03 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  34.71 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  37.2 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  36.61 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  34.23 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  36.39 
 
 		 342 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  36.13 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  31.88 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  34.86 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  35.31 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  35.8 
 
 		 473 aa  188  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  35.22 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  34.38 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  34.49 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  34.2 
 
 		 363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  34.49 
 
 		 363 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  34.2 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  33.81 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  33.81 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  35.26 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  34.63 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  30.37 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  33.82 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  31.45 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  34.02 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.78 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  31.38 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  32.55 
 
 		 448 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.34 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.39 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  30.82 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.54 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  32.64 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.34 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  32.81 
 
 		 426 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30 
 
 		 420 aa  142  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  31.1 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.62 
 
 		 417 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.75 
 
 		 429 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.17 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  26.51 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  32.43 
 
 		 464 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 		 483 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  26.38 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  36.44 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  31.99 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  31.07 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.83 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 		 427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  31.19 
 
 		 490 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.61 
 
 		 446 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  29.88 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  28.41 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  27.08 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.36 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.86 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18421  hypothetical protein  29.91 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.465045 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  30.84 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  30.84 
 
 		 442 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.21 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.21 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 		 422 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  32.46 
 
 		 457 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  27.5 
 
 		 433 aa  129  7.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  32.41 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.34 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  27.69 
 
 		 477 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0974  SBC domain-containing protein  29.61 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  31.98 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  29.88 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  29.88 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  29.88 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  28.74 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  27.04 
 
 		 421 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  27.04 
 
 		 421 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.8 
 
 		 429 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  29.38 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  28.88 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  27.57 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  29.48 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  29.14 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>