More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1479 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1479  CBS  100 
 
 
345 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000161298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1941  hypothetical protein  68.54 
 
 
344 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3134  protein of unknown function DUF21  65.7 
 
 
345 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0980  protein of unknown function DUF21  60.59 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.289763  hitchhiker  0.000463308 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1465  protein of unknown function DUF21  39.58 
 
 
358 aa  229  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0830  protein of unknown function DUF21  39.63 
 
 
376 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002181  hemolysin  38.81 
 
 
377 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2649  hypothetical protein  38.32 
 
 
352 aa  222  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2826  protein of unknown function DUF21  39.1 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1110  hypothetical protein  39.66 
 
 
424 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0649208  normal  0.107643 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00214  hemolysin  37.61 
 
 
377 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1845  hypothetical protein  38.37 
 
 
358 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1585  hypothetical protein  38.44 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000057212  hitchhiker  0.00124037 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1275  hypothetical protein  39.04 
 
 
473 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0255228  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4954  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2847  putative modulator of ion transport  35.63 
 
 
353 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00389186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0859  CBS domain-containing protein  36.84 
 
 
394 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000318514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03564  hypothetical protein  38.35 
 
 
360 aa  208  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3454  hypothetical protein  35.09 
 
 
342 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1671  hypothetical protein  36.2 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2362  hypothetical protein  36.69 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000165508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1112  hypothetical protein  34.39 
 
 
360 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.937546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1595  protein of unknown function DUF21  31.45 
 
 
347 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0187  hypothetical protein  34.52 
 
 
347 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.685974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1540  hypothetical protein  35.57 
 
 
362 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03595  hypothetical protein  32.94 
 
 
363 aa  185  8e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3624  hypothetical protein  36.5 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1301  hypothetical protein  35.82 
 
 
356 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.216137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2369  hypothetical protein  36.63 
 
 
356 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.458769  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1428  hypothetical protein  35.52 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2656  hypothetical protein  35.03 
 
 
363 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1286  hypothetical protein  36.61 
 
 
377 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3009  hypothetical protein  35.14 
 
 
363 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0289928  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2994  hypothetical protein  34.86 
 
 
363 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.466734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1369  protein of unknown function DUF21  35.14 
 
 
363 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3152  hypothetical protein  34.86 
 
 
363 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.364653  hitchhiker  0.00831155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1224  hypothetical protein  34.57 
 
 
363 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.668567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1295  hypothetical protein  34.57 
 
 
378 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1225  hypothetical protein  34.57 
 
 
363 aa  176  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.736158  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3316  hypothetical protein  34.86 
 
 
363 aa  175  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.57 
 
 
420 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.67 
 
 
464 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.15 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.34 
 
 
417 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.72 
 
 
420 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  29.7 
 
 
417 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  27.96 
 
 
420 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.96 
 
 
464 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.96 
 
 
464 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  29.51 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.27 
 
 
422 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.88 
 
 
442 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  29.77 
 
 
446 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  28.88 
 
 
421 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  30.79 
 
 
483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 
433 aa  137  4e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  26.61 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.7 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.21 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  28.21 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.81 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.81 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.81 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.39 
 
 
443 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.81 
 
 
435 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  30.31 
 
 
432 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
435 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  29.28 
 
 
442 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 
435 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.28 
 
 
442 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  25.67 
 
 
424 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0507  CBS domain-containing protein  27.05 
 
 
341 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.43 
 
 
429 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.23 
 
 
422 aa  132  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  28.75 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  28.53 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  28.53 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  27.96 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.22 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 
427 aa  130  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  27.02 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  28.7 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 
467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
435 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.11 
 
 
423 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  26.01 
 
 
424 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  29.39 
 
 
412 aa  129  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  28.78 
 
 
442 aa  129  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  28.78 
 
 
442 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 
444 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  28.33 
 
 
451 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 
439 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  28.49 
 
 
490 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  28.36 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  28.73 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  28.49 
 
 
442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  27 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.04 
 
 
434 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>